More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5933 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5933  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 315 aa  624  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0593223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  40.91 
 
 		 295 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7048  transcriptional regulator, LysR family  33.96 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 303 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 303 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  39.47 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4573  Transcriptional regulator-like protein  32.18 
 
 		 340 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 307 aa  99.4  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4123  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.454072 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2391  transcriptional regulator, LysR family  41.71 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0830106  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1308  LysR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3831  LysR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4537  LysR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1296  transcriptional regulator, LysR family  40.61 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.502339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2713  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.2 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2752  transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000767643 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.98 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  34.98 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  34.98 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3071  LysR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 303 aa  97.1  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0185768  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 297 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  32.29 
 
 		 299 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  34.98 
 
 		 297 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 297 aa  96.3  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3962  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 302 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195836  normal  0.175267 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4425  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 302 aa  95.5  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2323  LysR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 305 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  30.82 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3285  LysR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5031  transcriptional regulator, LysR family  35.05 
 
 		 289 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  34.98 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2138  transcriptional regulator, LysR family  38.86 
 
 		 337 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1657  LysR substrate binding domain-containing protein  34.08 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1852  LysR substrate binding domain-containing protein  34.08 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.33 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1598  LysR substrate binding domain protein  34.08 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1685  LysR substrate binding domain protein  34.08 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.533068  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1589  LysR substrate binding domain protein  34.08 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 297 aa  93.2  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1027  LysR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 299 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 		 299 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0544  transcriptional regulator, LysR family  41.71 
 
 		 295 aa  92.8  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4970  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126085  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4367  LysR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 300 aa  92.8  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 		 299 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08550  Transcriptional regulator, LysR family  32.45 
 
 		 307 aa  92.4  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763554  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 295 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  33.86 
 
 		 301 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 302 aa  92.4  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0374  transcriptional regulator, LysR family  29.18 
 
 		 330 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492908  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  33.86 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  33.86 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3724  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  33.86 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  33.86 
 
 		 301 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1134  LysR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 294 aa  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1346  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 294 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.638115  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  33.92 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1672  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1131  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 310 aa  90.5  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1447  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 316 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2909  transcriptional regulator, LysR family  27.87 
 
 		 299 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0304015  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1190  LysR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 292 aa  90.1  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  37.23 
 
 		 306 aa  90.1  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 304 aa  90.1  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  34.07 
 
 		 304 aa  89.7  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  37.23 
 
 		 306 aa  90.1  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 306 aa  90.1  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5055  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 319 aa  90.1  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5862  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 		 323 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.368193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1374  LysR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 314 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6954  transcriptional regulator, LysR family  31.12 
 
 		 306 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2025  LysR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 293 aa  89.4  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.639957  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1392  LysR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 306 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0389535  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>