More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2872 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 302 aa  606  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  44.9 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  44.11 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  41.33 
 
 		 333 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  43.31 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 334 aa  172  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  38.87 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 		 294 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  35.23 
 
 		 298 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  35.45 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 296 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 312 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  34.45 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  33.81 
 
 		 287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  31.69 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  35.27 
 
 		 308 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 301 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  34.21 
 
 		 315 aa  132  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  34.65 
 
 		 304 aa  129  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 300 aa  129  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  37.59 
 
 		 315 aa  125  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 327 aa  123  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 288 aa  122  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  32.11 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  35.43 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  34.59 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  31.56 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 339 aa  116  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 319 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  31.2 
 
 		 301 aa  115  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8854  LysR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  30.35 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  32.61 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 292 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  32.97 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  33.61 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  31.16 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  31.06 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  29.02 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  30.7 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3401  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 302 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  29.87 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  33.88 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  33.47 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  29.2 
 
 		 310 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  33.33 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0450  LysR substrate-binding protein  31.15 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  29.87 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3379  LysR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  31.34 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4988  LysR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  32.55 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  29.47 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 302 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  32.13 
 
 		 303 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  27.92 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3948  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  32.51 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2544  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 300 aa  99.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0984343  normal  0.803064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  31.42 
 
 		 308 aa  99  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 301 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  30.36 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 327 aa  96.7  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 308 aa  95.5  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  29.67 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>