More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2395 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
641 aa  1257    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357477  hitchhiker  0.00709573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1795  ABC transporter permease protein  54.98 
 
 
654 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.697698  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.13 
 
 
664 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0265389  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.25 
 
 
663 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3425  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  29.93 
 
 
686 aa  273  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0257015 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
660 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.445711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0363  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.76 
 
 
283 aa  211  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67280  ABC transporter permease  41.38 
 
 
283 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5829  ABC transporter permease  41.38 
 
 
283 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4830  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.96 
 
 
283 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5272  histidine ABC transporter, permease protein, putative  41.26 
 
 
283 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.27 
 
 
294 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.61 
 
 
294 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.75 
 
 
285 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.320123  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0691  putative glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  43.18 
 
 
299 aa  196  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0739  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein, putative  43.18 
 
 
301 aa  196  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.483672  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.6 
 
 
301 aa  196  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3449  choline ABC transporter, permease protein  37.37 
 
 
301 aa  193  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4810  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.64 
 
 
298 aa  192  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2377  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  41.22 
 
 
274 aa  192  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.336492 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.92 
 
 
295 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.18 
 
 
298 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5091  choline ABC transporter, permease protein  43.18 
 
 
298 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.674099 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4566  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.18 
 
 
298 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.669781 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.18 
 
 
298 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00870989  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5108  choline ABC transporter, permease protein  43.18 
 
 
298 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 
317 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.565238  normal  0.807022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
279 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0079247  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 
300 aa  190  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.287103  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0967  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein, putative  42.73 
 
 
300 aa  190  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.71 
 
 
283 aa  190  9e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.158267  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3486  choline ABC transporter, permease protein  42.73 
 
 
298 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.180465 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0456  ABC glycine betaine/L-proline transporter, inner membrane subunit  42.73 
 
 
298 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.424903  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2844  ABC proline/glycine betaine transporter, inner membrane subunit  50.75 
 
 
321 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.852577 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.29 
 
 
283 aa  189  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000490097  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1869  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  42.27 
 
 
300 aa  188  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1932  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  42.27 
 
 
300 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0565  putative glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  42.27 
 
 
300 aa  188  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.120464  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0449  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  42.27 
 
 
300 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2026  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  42.27 
 
 
300 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0902  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  42.27 
 
 
300 aa  188  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.16 
 
 
283 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.16 
 
 
283 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0151467  normal  0.023955 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.77 
 
 
280 aa  187  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.54971  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.16 
 
 
283 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127459  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.16 
 
 
283 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260591  normal  0.31699 
 
 
-
 
NC_003296  RS02042  transmembrane ABC transporter protein  41.04 
 
 
298 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.68 
 
 
278 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0667053  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.99 
 
 
281 aa  184  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.730123  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.46 
 
 
290 aa  185  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0808444  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.7 
 
 
281 aa  184  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3477  glycine betaine transporter membrane protein  43.72 
 
 
400 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.83 
 
 
282 aa  184  5.0000000000000004e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2781  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase/permease fusion protein, putative  42.45 
 
 
698 aa  183  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3158  glycine betaine transporter membrane protein  38.97 
 
 
355 aa  183  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.363018  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3321  glycine betaine transporter membrane protein  43.32 
 
 
422 aa  183  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.26 
 
 
400 aa  183  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1496  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.3 
 
 
451 aa  183  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0787924  normal  0.370511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.26 
 
 
400 aa  183  9.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0842907  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1902  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.77 
 
 
276 aa  183  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00849188  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 
281 aa  182  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.542152 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1376  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  44.14 
 
 
652 aa  182  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369923 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.56 
 
 
279 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.22836 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1796  amino acid ABC transporter, permease protein  40.57 
 
 
575 aa  181  4.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.135141  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 
399 aa  181  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00496589  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
293 aa  181  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3999  glycine betaine/L-proline ABC transporter inner membrane protein  49.48 
 
 
313 aa  180  8e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
278 aa  180  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000001583  hitchhiker  0.0000000544844 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1615  ABC proline/glycine betaine transporter, inner membrane subunit  41.2 
 
 
300 aa  180  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.39 
 
 
299 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.59 
 
 
303 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3058  ABC proline/glycine betaine transporter, inner membrane subunit  39.59 
 
 
303 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3734  glycine betaine transporter membrane protein  41.94 
 
 
374 aa  179  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.8 
 
 
383 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 
293 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00518726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3093  choline ABC transporter, permease protein  40.91 
 
 
285 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.499951  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.85 
 
 
282 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2800  glycine betaine transporter membrane protein  40.34 
 
 
354 aa  178  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal  0.0101611 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1060  glycine betaine transporter membrane protein  36.16 
 
 
388 aa  178  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0502  ABC glycine betaine/L-proline transporter, inner membrane subunit  37.4 
 
 
276 aa  178  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.819479  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1114  glycine betaine transporter membrane protein  36.16 
 
 
388 aa  178  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0896  glycine betaine transporter membrane protein  36.15 
 
 
392 aa  178  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.652731  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3535  glycine betaine transporter membrane protein  36.16 
 
 
388 aa  177  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.872834  normal  0.0140856 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2959  glycine betaine transporter membrane protein  42.69 
 
 
354 aa  177  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3201  glycine betaine transporter membrane protein  42.69 
 
 
354 aa  177  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.17 
 
 
327 aa  177  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00444085  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0145  glycine betaine, L-proline ABC transporter, permease protein  44.5 
 
 
299 aa  177  6e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2774  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase/permease fusion protein, putative  42.68 
 
 
698 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4110  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  38.08 
 
 
662 aa  177  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.12 
 
 
282 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02534  glycine betaine transporter subunit  40 
 
 
354 aa  177  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
354 aa  177  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1028  glycine betaine transporter membrane protein  40 
 
 
354 aa  177  8e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.230597 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02498  hypothetical protein  40 
 
 
354 aa  177  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3922  glycine betaine transporter membrane protein  40 
 
 
354 aa  177  8e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.280757 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2814  glycine betaine transporter membrane protein  40 
 
 
354 aa  177  8e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
277 aa  176  9e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.281492  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3059  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  42.04 
 
 
321 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
298 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00873954  hitchhiker  0.00370513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5041  choline ABC transporter, permease protein  42.31 
 
 
300 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.503755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>