More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1102 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 300 aa  600  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  59.15 
 
 		 299 aa  332  3e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  58.06 
 
 		 291 aa  326  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  59.14 
 
 		 296 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  60.21 
 
 		 299 aa  324  9e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  58.57 
 
 		 293 aa  323  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  57.24 
 
 		 329 aa  316  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  55.97 
 
 		 303 aa  310  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  55.04 
 
 		 291 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  57.55 
 
 		 290 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  56.99 
 
 		 300 aa  300  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  53.82 
 
 		 291 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  54.61 
 
 		 320 aa  295  5e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  53.1 
 
 		 287 aa  293  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  53.4 
 
 		 304 aa  293  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  56.12 
 
 		 288 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  56.12 
 
 		 288 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  56.12 
 
 		 288 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  53.77 
 
 		 303 aa  289  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  56.83 
 
 		 291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  54.06 
 
 		 300 aa  285  7e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  51.9 
 
 		 288 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  53.96 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  51.04 
 
 		 310 aa  276  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  56.32 
 
 		 315 aa  270  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  53.74 
 
 		 313 aa  262  4.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  51.44 
 
 		 335 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  53.74 
 
 		 313 aa  260  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  50.33 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  51.07 
 
 		 285 aa  255  5e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  50.18 
 
 		 311 aa  254  9e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  50.87 
 
 		 308 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  51.59 
 
 		 311 aa  249  5e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  47.18 
 
 		 347 aa  247  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  50.35 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  53.16 
 
 		 581 aa  241  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  42.86 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  41.1 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  44 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  40.64 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  43.37 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  41.28 
 
 		 368 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.44 
 
 		 348 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  43.17 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  37.99 
 
 		 306 aa  152  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.84 
 
 		 361 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  37.87 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  33.91 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  39.17 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  39.17 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  39.17 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  35.71 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.91 
 
 		 372 aa  149  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  38.75 
 
 		 368 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  38.75 
 
 		 368 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  38.75 
 
 		 368 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  38.75 
 
 		 368 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  39.9 
 
 		 381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  36.8 
 
 		 354 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.91 
 
 		 372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  40.39 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.91 
 
 		 372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  39.42 
 
 		 363 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 		 368 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 		 368 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 		 368 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  34.75 
 
 		 365 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  40.78 
 
 		 360 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 		 370 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  40.64 
 
 		 363 aa  145  8.000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  36.59 
 
 		 309 aa  144  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  38.89 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  37.23 
 
 		 369 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  34.22 
 
 		 345 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  37.27 
 
 		 355 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  34.22 
 
 		 345 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  38.94 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  38.94 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  38.94 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  37.75 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  38.94 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  39.66 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  40.16 
 
 		 615 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  39.74 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  42.65 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.11 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.91 
 
 		 368 aa  143  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  43.84 
 
 		 373 aa  143  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  38.99 
 
 		 361 aa  143  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  38.75 
 
 		 368 aa  143  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  40.74 
 
 		 355 aa  142  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  36 
 
 		 350 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  36 
 
 		 360 aa  142  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.33 
 
 		 357 aa  142  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  36.89 
 
 		 382 aa  142  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  36 
 
 		 350 aa  142  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  36 
 
 		 350 aa  142  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  36 
 
 		 360 aa  142  8e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  38.53 
 
 		 368 aa  142  8e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.93 
 
 		 368 aa  142  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>