More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0902 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0902  ABC transporter related protein  100 
 
 
555 aa  1121    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.118594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9185  ABC transporter related protein  58.48 
 
 
536 aa  645    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0719  ABC transporter related  60.22 
 
 
569 aa  641    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3891  ABC transporter related  70.89 
 
 
554 aa  795    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1338  ABC transporter related protein  61.12 
 
 
539 aa  645    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0882  ABC transporter related  59.58 
 
 
574 aa  652    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.743322  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4282  ABC transporter related  71.45 
 
 
559 aa  790    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184754  hitchhiker  0.00727726 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29380  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  57.42 
 
 
562 aa  629  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186742  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1325  ABC transporter related  57.58 
 
 
572 aa  625  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4144  ABC transporter related  56.25 
 
 
560 aa  616  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2749  ABC transporter related protein  59.18 
 
 
561 aa  616  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.308133  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3918  ABC transporter related  56.07 
 
 
564 aa  593  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0525  ABC transporter related  55.97 
 
 
560 aa  588  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0938  ABC transporter related protein  57.07 
 
 
539 aa  590  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02910  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  54.64 
 
 
571 aa  586  1e-166  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0969  ABC transporter related  54.95 
 
 
553 aa  581  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350056  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2614  ABC transporter related protein  58.06 
 
 
558 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1465  ABC transporter related protein  56.29 
 
 
544 aa  570  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7235  ABC transporter related protein  56.08 
 
 
543 aa  566  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1583  ABC transporter related  53.89 
 
 
542 aa  559  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0413  ABC transporter related protein  42.51 
 
 
488 aa  322  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.630834  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  28.25 
 
 
643 aa  202  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  31.98 
 
 
620 aa  193  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  29.47 
 
 
668 aa  192  9e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  28.78 
 
 
622 aa  191  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  30.99 
 
 
645 aa  189  9e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  29.85 
 
 
690 aa  187  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  29.31 
 
 
642 aa  186  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  29.31 
 
 
642 aa  186  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  30.22 
 
 
767 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  29.3 
 
 
636 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.57 
 
 
644 aa  184  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  28.49 
 
 
630 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  27.45 
 
 
639 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  30.71 
 
 
649 aa  183  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  29.22 
 
 
543 aa  183  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  30.29 
 
 
649 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  29.87 
 
 
649 aa  182  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  29.46 
 
 
545 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  29.85 
 
 
549 aa  181  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  29.57 
 
 
709 aa  180  4.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  29.28 
 
 
552 aa  178  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  28.6 
 
 
631 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  27.84 
 
 
636 aa  178  3e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  27.83 
 
 
643 aa  177  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  29.36 
 
 
631 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  29.36 
 
 
631 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  28.65 
 
 
635 aa  174  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  30.47 
 
 
645 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  27.85 
 
 
641 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0013  ABC transporter related  26.18 
 
 
540 aa  174  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  27.05 
 
 
645 aa  173  7.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  29.86 
 
 
641 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  29.17 
 
 
631 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  29.54 
 
 
631 aa  173  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  29.17 
 
 
631 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0254  ABC transporter, ATP-binding protein  28.1 
 
 
524 aa  172  1e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  28.99 
 
 
631 aa  172  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  28.99 
 
 
631 aa  172  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  28.6 
 
 
630 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4945  ABC transporter related  28.42 
 
 
561 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  29.36 
 
 
631 aa  172  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  28.99 
 
 
631 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  28.99 
 
 
631 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  27.66 
 
 
645 aa  171  4e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  27.96 
 
 
652 aa  171  5e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  28.04 
 
 
659 aa  170  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  29.01 
 
 
685 aa  170  7e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  27.2 
 
 
627 aa  169  8e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  26.2 
 
 
632 aa  170  8e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  28.49 
 
 
659 aa  169  9e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  26.17 
 
 
634 aa  169  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  27.12 
 
 
644 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  30.84 
 
 
536 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  28.12 
 
 
653 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  28.15 
 
 
641 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  29.13 
 
 
640 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0144  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.45 
 
 
553 aa  169  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  26.92 
 
 
642 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  29.53 
 
 
664 aa  169  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2271  ABC transporter related  30.49 
 
 
532 aa  169  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.582561 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0133  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.27 
 
 
553 aa  168  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0668164  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0571  ABC transporter, ATP-binding protein  26.95 
 
 
645 aa  169  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.940937  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  26.16 
 
 
646 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  28.03 
 
 
543 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  27.68 
 
 
663 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  27.82 
 
 
544 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.55 
 
 
555 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  27.21 
 
 
637 aa  168  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  27.99 
 
 
658 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2242  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.63 
 
 
553 aa  167  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  30.4 
 
 
657 aa  167  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  28.68 
 
 
545 aa  167  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  29.4 
 
 
648 aa  167  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  27.68 
 
 
663 aa  167  5e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4883  ABC transporter related protein  30.13 
 
 
546 aa  167  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2634  ABC-type transport system, ATPase component  27.84 
 
 
544 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285179  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  26.01 
 
 
639 aa  167  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  26.95 
 
 
642 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2563  ABC transporter related  29.94 
 
 
532 aa  166  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0199173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>