More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0254 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1529  ABC transporter, ATP-binding protein  90.6 
 
 		 525 aa  959    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0432  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B (PPIase B; rotamase B)  71.43 
 
 		 529 aa  756    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2198  ABC transporter ATP-binding protein  70.25 
 
 		 529 aa  741    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0113236  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0475  ABC transporter, ATP-binding protein  91.17 
 
 		 525 aa  964    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0281807  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0413  ABC transporter ATP-binding protein  70.53 
 
 		 527 aa  746    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0187168  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1507  ABC transporter-related protein  62.48 
 
 		 534 aa  652    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0254  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 524 aa  1058    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  91.36 
 
 		 525 aa  967    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1696  ABC transporter related protein  66.86 
 
 		 531 aa  696    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3372  ABC transporter related  47.9 
 
 		 542 aa  474  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000385391  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2988  ABC transporter, ATP-binding protein  48.3 
 
 		 541 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000213646  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0227  ABC transporter related  47.05 
 
 		 537 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198546  normal  0.0874322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1434  ABC transporter related protein  48.01 
 
 		 543 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.36515 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2994  ABC transporter, ATP-binding protein  48.11 
 
 		 541 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000223296  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03121  ABC transporter ATP-binding protein  45.28 
 
 		 530 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2013  ABC transporter-related protein  48.11 
 
 		 541 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000145808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2949  ABC transporter related  47.24 
 
 		 545 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000330729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2689  ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 		 541 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000011561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2667  ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 		 541 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000362923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2630  ABC transporter-related protein  46.86 
 
 		 545 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2952  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 		 541 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2947  ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 		 541 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10459e-43 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0169  ABC transporter, ATP-binding protein  46.68 
 
 		 545 aa  464  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2738  ABC transporter ATP-binding protein  47.54 
 
 		 541 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000394733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2882  ABC transporter related  44.55 
 
 		 528 aa  464  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2948  ABC transporter ATP-binding protein  47.54 
 
 		 541 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000544577  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2288  ABC transporter, ATP-binding protein  47.54 
 
 		 541 aa  463  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000589648  hitchhiker  1.14082e-17 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2535  ABC transporter related  43.05 
 
 		 530 aa  458  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.776559  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3303  ABC transporter related protein  47.05 
 
 		 544 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0945  ABC transporter related  47.05 
 
 		 544 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000191472 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0962  ABC transporter, ATP-binding protein  47.26 
 
 		 535 aa  457  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.6502  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1127  ABC transporter, ATP-binding protein  44.23 
 
 		 530 aa  458  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1367  ABC transporter related  46.42 
 
 		 538 aa  455  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.213728  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  43.98 
 
 		 528 aa  455  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1560  ABC transporter related  45.08 
 
 		 554 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046751  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00787  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  43.05 
 
 		 530 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2822  ABC transporter related protein  43.05 
 
 		 530 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.596097  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1453  ABC transporter related  46.88 
 
 		 533 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1500  ABC transporter related  43.92 
 
 		 530 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0377572 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 		 530 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02269  hypothetical protein  43.81 
 
 		 530 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1482  ABC transporter related  46.88 
 
 		 533 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2609  ABC transporter-like  43.51 
 
 		 528 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2634  ABC-type transport system, ATPase component  45.23 
 
 		 544 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285179  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1852  ABC transporter related protein  46.3 
 
 		 541 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0969  ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 		 530 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.12537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1943  ABC transporter, fused ATPase subunits  44.49 
 
 		 530 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.002693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0890  ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 		 530 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725571  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2528  ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 		 530 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138533  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2823  ABC transporter related  43.05 
 
 		 530 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1409  ABC transporter related  42.86 
 
 		 530 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3011  ABC transporter related  45.71 
 
 		 545 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00994639  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00804  hypothetical protein  43.05 
 
 		 530 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0877  ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 		 530 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28710  ABC transporter, ATP binding component  42.83 
 
 		 521 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2525  ABC transporter, ATP-binding protein  44.42 
 
 		 533 aa  450  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003501  ABC transporter ATP-binding protein  43.62 
 
 		 530 aa  451  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1844  ABC transporter related  43.18 
 
 		 540 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3550  ABC transporter related  46.11 
 
 		 545 aa  451  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000348085  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2836  ABC transporter related  43.32 
 
 		 528 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104102  normal  0.187196 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2269  ABC transporter, ATP-binding protein  43.92 
 
 		 530 aa  451  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2750  ABC transporter related  43.13 
 
 		 528 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.742675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2483  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 531 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0906  ABC transporter ATP-binding protein  42.48 
 
 		 530 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.753314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2936  ABC transporter ATP-binding protein  43.13 
 
 		 528 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.914866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2315  ABC transporter related  43.54 
 
 		 530 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751632  normal  0.0855999 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1592  ABC transporter, ATP-binding protein  43.88 
 
 		 550 aa  446  1.0000000000000001e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.717967  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0990  ABC transporter ATP-binding protein  42.48 
 
 		 531 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2186  ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 		 555 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2581  ABC transporter related  42.67 
 
 		 531 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1308  ABC transporter, ATP-binding protein  43.54 
 
 		 530 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1311  ABC transporter related  42.1 
 
 		 531 aa  447  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0878  ABC transporter, ATP-binding protein  42.48 
 
 		 530 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.720445  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2318  putative ABC transport system, ATP-binding protein  43.35 
 
 		 555 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5068  ABC transporter, fused ATPase subunits  43.92 
 
 		 530 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.882741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 		 599 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1839  ABC transporter related  44.3 
 
 		 536 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.645779  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2755  ABC transporter related  43.13 
 
 		 528 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1285  ABC transporter related  43.62 
 
 		 530 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143824  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1135  ABC transporter related  44.47 
 
 		 531 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.521044  normal  0.0732961 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1795  ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 		 599 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0657845  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2150  ABC transporter ATPase  43.54 
 
 		 599 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911921  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6309  ABC transporter related  43.73 
 
 		 530 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1770  ABC transporter related  43.73 
 
 		 530 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210956  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0969  ABC transporter ATP-binding protein  42.48 
 
 		 531 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2753  ABC transporter related  42.48 
 
 		 530 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0100  ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 		 599 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388339  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0936  ABC transporter ATP-binding protein  42.48 
 
 		 530 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1709  ABC transporter related  43.73 
 
 		 530 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1795  ABC transporter related  43.73 
 
 		 530 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.348279 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1366  ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 534 aa  442  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3332  ABC transporter ATP-binding protein  43.05 
 
 		 529 aa  445  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2999  ABC transporter ATP-binding protein  42.67 
 
 		 587 aa  444  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000839463 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1559  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.53 
 
 		 531 aa  443  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2209  ABC transporter related  43.86 
 
 		 530 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1961  ABC transporter related  42.86 
 
 		 534 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2480  ABC transporter related  43.21 
 
 		 529 aa  444  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2084  ABC transporter related  43.86 
 
 		 530 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1891  ABC transporter related  43.86 
 
 		 530 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2077  ABC transporter related  43.35 
 
 		 553 aa  444  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>