More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0500 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0500  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 498 aa  989    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.178401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4735  AMP-dependent synthetase and ligase  39.42 
 
 		 509 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.660645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4677  AMP-dependent synthetase and ligase  40.56 
 
 		 507 aa  296  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.65065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1851  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000851454 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  37.78 
 
 		 468 aa  234  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.03963  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1049  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 		 495 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4602  AMP-dependent synthetase and ligase  33.88 
 
 		 506 aa  204  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.666881  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2006  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 		 487 aa  200  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3658  acyl-CoA synthetase  27.33 
 
 		 487 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0286615  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3647  acyl-CoA synthetase  27.57 
 
 		 487 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3330  acyl-CoA synthetase  27.54 
 
 		 559 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3639  acyl-CoA synthetase  27.54 
 
 		 487 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2517  AMP-dependent synthetase and ligase  35.58 
 
 		 459 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.570913  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3380  acyl-CoA synthetase  27.54 
 
 		 559 aa  179  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000453165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3419  acyl-CoA synthetase  27.61 
 
 		 559 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00837827  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3688  acyl-CoA synthetase  27.61 
 
 		 487 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000138735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3736  acyl-CoA synthetase  27.77 
 
 		 487 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0219  long chain fatty acid CoA ligase, putative  28.07 
 
 		 453 aa  177  5e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1581  acyl-CoA synthetase  28.01 
 
 		 487 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000337564  normal  0.0607251 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3314  acyl-CoA synthetase  26.94 
 
 		 487 aa  172  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000215254  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1541  AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 		 494 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2318  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 		 494 aa  160  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  33.81 
 
 		 508 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  30.79 
 
 		 560 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  31.54 
 
 		 577 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  31.54 
 
 		 577 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 532 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.61 
 
 		 516 aa  157  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  31.54 
 
 		 574 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  32.32 
 
 		 516 aa  156  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 		 527 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  28.74 
 
 		 569 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.15 
 
 		 509 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 		 509 aa  149  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  28 
 
 		 499 aa  147  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 		 522 aa  147  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  29.89 
 
 		 544 aa  147  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 		 532 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.42 
 
 		 514 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  29.88 
 
 		 539 aa  145  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  28.41 
 
 		 548 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  28.41 
 
 		 548 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  28.41 
 
 		 548 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  31.14 
 
 		 564 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  28.99 
 
 		 530 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  31.9 
 
 		 516 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.95 
 
 		 509 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.82 
 
 		 518 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  30.28 
 
 		 511 aa  144  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  31.37 
 
 		 487 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  27.8 
 
 		 535 aa  143  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1995  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 541 aa  143  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 		 510 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4107  AMP-dependent synthetase and ligase  28.71 
 
 		 519 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  27.66 
 
 		 516 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5455  hypothetical protein  30.57 
 
 		 459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 		 516 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.75 
 
 		 514 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  27.68 
 
 		 540 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.42 
 
 		 522 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.41 
 
 		 514 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  29.9 
 
 		 516 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.63 
 
 		 500 aa  140  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  29.37 
 
 		 523 aa  140  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  28.06 
 
 		 508 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  29.64 
 
 		 525 aa  139  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  27.98 
 
 		 541 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 		 501 aa  139  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  28.26 
 
 		 492 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.2 
 
 		 543 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.79 
 
 		 509 aa  138  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.83 
 
 		 536 aa  137  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.098527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  29.66 
 
 		 501 aa  136  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  29.66 
 
 		 501 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6162  AMP-dependent synthetase and ligase  31.34 
 
 		 487 aa  136  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0435  acyl-CoA synthetase  28.98 
 
 		 544 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  29.66 
 
 		 501 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  27.15 
 
 		 506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0111  AMP-dependent synthetase and ligase  28.15 
 
 		 526 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.471366  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0598  AMP-dependent synthetase and ligase  23.7 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.58 
 
 		 512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4921  acyl-CoA synthetase  25.51 
 
 		 531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0612  AMP-dependent synthetase and ligase  23.7 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 		 520 aa  135  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  31.3 
 
 		 504 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  25.3 
 
 		 511 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  28.61 
 
 		 515 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  31.87 
 
 		 492 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.34 
 
 		 516 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  29.68 
 
 		 535 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.29 
 
 		 516 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  30.46 
 
 		 504 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2789  AMP-dependent synthetase and ligase  30.31 
 
 		 384 aa  133  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  31.2 
 
 		 520 aa  133  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4678  AMP-dependent synthetase and ligase  30.97 
 
 		 539 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0051  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 		 546 aa  133  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256371 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 		 492 aa  133  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  26.12 
 
 		 497 aa  133  9e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  30.39 
 
 		 503 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6175  AMP-dependent synthetase and ligase  27.55 
 
 		 537 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>