237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0363 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_1418  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  69.11 
 
 		 505 aa  647    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221692  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0363  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  968    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6112  hypothetical protein  67.72 
 
 		 505 aa  643    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3602  hypothetical protein  77.46 
 
 		 489 aa  733    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3488  hypothetical protein  69.5 
 
 		 505 aa  650    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  69.7 
 
 		 505 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  69.9 
 
 		 505 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  70.5 
 
 		 505 aa  668    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3315  hypothetical protein  70.3 
 
 		 505 aa  665    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331598  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  69.31 
 
 		 505 aa  660    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  84.97 
 
 		 499 aa  826    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6183  protein of unknown function DUF112 transmembrane  71.08 
 
 		 499 aa  641    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3919  hypothetical protein  68.29 
 
 		 514 aa  631  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2511  hypothetical protein  62.47 
 
 		 495 aa  585  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347112  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  61.29 
 
 		 500 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0831  hypothetical protein  63.23 
 
 		 504 aa  554  1e-156  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0103108  normal  0.527438 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  61.29 
 
 		 512 aa  548  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3431  hypothetical protein  57.96 
 
 		 504 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8068  hypothetical protein  63.27 
 
 		 499 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.806841 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  57.96 
 
 		 504 aa  535  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  56.21 
 
 		 509 aa  529  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3702  protein of unknown function DUF112 transmembrane  66.52 
 
 		 507 aa  527  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863091  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37810  hypothetical protein  58.84 
 
 		 504 aa  521  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133674 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3442  protein of unknown function DUF112 transmembrane  60.68 
 
 		 511 aa  522  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513015  normal  0.755379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3006  hypothetical protein  60.55 
 
 		 513 aa  519  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0383827 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3009  hypothetical protein  57.03 
 
 		 504 aa  518  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.790814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2070  protein of unknown function DUF112 transmembrane  56.21 
 
 		 509 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2520  hypothetical protein  57.49 
 
 		 504 aa  514  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0500979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3500  hypothetical protein  58.67 
 
 		 513 aa  514  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583954  normal  0.298668 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1236  hypothetical protein  58.11 
 
 		 507 aa  514  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2011  hypothetical protein  57.4 
 
 		 501 aa  509  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3008  protein of unknown function DUF112 transmembrane  57.74 
 
 		 504 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2567  hypothetical protein  57.47 
 
 		 495 aa  493  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1393  hypothetical protein  59.8 
 
 		 539 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0764737  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0397  hypothetical protein  59.32 
 
 		 497 aa  494  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.331622  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3627  protein of unknown function DUF112 transmembrane  62.17 
 
 		 538 aa  491  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.854154  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3104  hypothetical protein  54.76 
 
 		 520 aa  490  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.893861  normal  0.627849 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0996  protein of unknown function DUF112 transmembrane  55.32 
 
 		 513 aa  482  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0594  protein of unknown function DUF112 transmembrane  59.76 
 
 		 512 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.006033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3235  hypothetical protein  60.17 
 
 		 516 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3246  hypothetical protein  60.17 
 
 		 516 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.442644  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3297  hypothetical protein  60.17 
 
 		 516 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0388463 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1827  protein of unknown function DUF112 transmembrane  52.87 
 
 		 518 aa  464  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4161  protein of unknown function DUF112 transmembrane  47.21 
 
 		 503 aa  455  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00860  hypothetical protein  48.41 
 
 		 501 aa  458  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0201156  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2146  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.03 
 
 		 517 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0068  protein of unknown function DUF112 transmembrane  63.33 
 
 		 518 aa  449  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.29 
 
 		 508 aa  422  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  44.71 
 
 		 500 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  46.41 
 
 		 503 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  46.14 
 
 		 504 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  45.88 
 
 		 500 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  46.19 
 
 		 500 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  45.66 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0321  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.87 
 
 		 501 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.7 
 
 		 503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  45.68 
 
 		 505 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.22 
 
 		 504 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  46.03 
 
 		 503 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  45.49 
 
 		 503 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  44.95 
 
 		 502 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.33 
 
 		 502 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  45.67 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  43.51 
 
 		 501 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.51 
 
 		 500 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.51 
 
 		 500 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  44.27 
 
 		 500 aa  395  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.31 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  45.15 
 
 		 500 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.72 
 
 		 506 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.98 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  44.51 
 
 		 502 aa  391  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  45.82 
 
 		 503 aa  391  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  48.41 
 
 		 501 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.78 
 
 		 501 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.33 
 
 		 503 aa  386  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  44.51 
 
 		 502 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  41.72 
 
 		 506 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  45.01 
 
 		 500 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  45.65 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.07 
 
 		 500 aa  383  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  45.19 
 
 		 500 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  40.48 
 
 		 504 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  40.48 
 
 		 504 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  40.28 
 
 		 504 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.2 
 
 		 536 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  40.28 
 
 		 504 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  41.65 
 
 		 507 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  40.28 
 
 		 504 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.66 
 
 		 500 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  41.28 
 
 		 508 aa  375  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  44.83 
 
 		 515 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  42.33 
 
 		 505 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  46.61 
 
 		 502 aa  372  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  42.56 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.64 
 
 		 503 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.81 
 
 		 519 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  40.29 
 
 		 500 aa  366  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2563  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.37 
 
 		 500 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.28 
 
 		 506 aa  368  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>