More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3362 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3362  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  100 
 
 
246 aa  502  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155625  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02411  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  85.77 
 
 
246 aa  444  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0254  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  83.67 
 
 
246 aa  432  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0283  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  83.67 
 
 
246 aa  432  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1585  acetyacetyl-CoA reductase  66.26 
 
 
246 aa  360  9e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  65.45 
 
 
246 aa  360  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1914  acetyacetyl-CoA reductase  66.26 
 
 
246 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.044907 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1633  acetyacetyl-CoA reductase  65.45 
 
 
246 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.389319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  63.41 
 
 
246 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  64.23 
 
 
246 aa  353  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  63.41 
 
 
246 aa  352  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  63.82 
 
 
246 aa  350  8.999999999999999e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  63.01 
 
 
246 aa  348  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  63.41 
 
 
246 aa  348  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  63.41 
 
 
246 aa  348  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  62.6 
 
 
246 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.486438 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  62.6 
 
 
246 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6290  acetyacetyl-CoA reductase  62.6 
 
 
246 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5090  acetyacetyl-CoA reductase  62.2 
 
 
246 aa  345  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682377  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  62.6 
 
 
248 aa  345  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  62.6 
 
 
246 aa  344  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  62.6 
 
 
246 aa  344  6e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  62.6 
 
 
246 aa  344  6e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  62.6 
 
 
246 aa  344  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  62.6 
 
 
246 aa  344  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  62.6 
 
 
246 aa  344  6e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  62.2 
 
 
260 aa  343  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  62.6 
 
 
246 aa  340  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  60.98 
 
 
246 aa  333  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  60.08 
 
 
244 aa  316  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2479  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  59.35 
 
 
245 aa  311  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200677  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2141  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  58.54 
 
 
245 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.968108  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2803  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  58.13 
 
 
245 aa  307  9e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000483642 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2560  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  58.13 
 
 
245 aa  305  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.562191  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3602  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.55 
 
 
245 aa  305  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0780439  normal  0.144025 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1868  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.72 
 
 
245 aa  305  6e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0923783  normal  0.101026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.72 
 
 
245 aa  304  7e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.882283  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.72 
 
 
245 aa  304  7e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.400825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  58.37 
 
 
245 aa  304  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.1 
 
 
245 aa  299  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  55.79 
 
 
247 aa  295  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  54.29 
 
 
246 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  51.85 
 
 
246 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  51.44 
 
 
246 aa  268  8e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  50.41 
 
 
247 aa  254  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  49.59 
 
 
277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  49.19 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  49.59 
 
 
247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1610  acetoacetyl-CoA reductase  52.24 
 
 
247 aa  251  7e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.710856 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  49.59 
 
 
264 aa  251  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  49.59 
 
 
264 aa  251  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  50 
 
 
247 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  47.33 
 
 
251 aa  247  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  48.78 
 
 
247 aa  247  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0166  acetoacetyl-CoA reductase  47.74 
 
 
248 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1337  acetoacetyl-CoA reductase  47.74 
 
 
248 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1014  acetoacetyl-CoA reductase  47.74 
 
 
248 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0193  acetoacetyl-CoA reductase  47.74 
 
 
248 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2744  acetoacetyl-CoA reductase  47.74 
 
 
248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163143  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  46.34 
 
 
247 aa  241  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  47.11 
 
 
248 aa  241  9e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2601  acetoacetyl-CoA reductase  47.33 
 
 
248 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  46.28 
 
 
249 aa  239  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2782  acetoacetyl-CoA reductase  48.51 
 
 
236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  46.53 
 
 
248 aa  238  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0461  acetoacetyl-CoA reductase  46.5 
 
 
248 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.957228  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  48.15 
 
 
248 aa  238  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  48.56 
 
 
248 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  47.35 
 
 
248 aa  235  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  47.35 
 
 
248 aa  235  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  48.15 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0557  acetoacetyl-CoA reductase  46.96 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.306822  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6101  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  47.23 
 
 
236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  45.45 
 
 
248 aa  231  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  47.33 
 
 
248 aa  231  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5566  acetoacetyl-CoA reductase  45.08 
 
 
248 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431609  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2205  acetoacetyl-CoA reductase  44.08 
 
 
248 aa  223  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000734439  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  43.44 
 
 
248 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00406  acetoacetyl-CoA reductase  46.34 
 
 
246 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2750  acetoacetyl-CoA reductase  46.75 
 
 
246 aa  219  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.826289  normal  0.454733 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1519  acetoacetyl-CoA reductase  45.53 
 
 
247 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.004615  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.93 
 
 
203 aa  219  5e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1025  acetoacetyl-CoA reductase  43.03 
 
 
248 aa  218  6e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  43.85 
 
 
248 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  45.31 
 
 
248 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1198  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  46.12 
 
 
249 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  44.21 
 
 
241 aa  216  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1166  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  42.45 
 
 
247 aa  214  9e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0201131  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2322  hypothetical protein  42.34 
 
 
247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  40.24 
 
 
252 aa  211  5.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1056  hypothetical protein  42.11 
 
 
247 aa  211  7e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3029  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  44.72 
 
 
249 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  42.45 
 
 
240 aa  209  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7613  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  44.03 
 
 
241 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0533  acetoacetyl-CoA reductase  44.86 
 
 
241 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3212  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  42.98 
 
 
240 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1515  acetoacetyl-CoA reductase  43.8 
 
 
249 aa  206  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0732362  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  42.8 
 
 
241 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0273  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.74 
 
 
242 aa  205  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2384  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.98 
 
 
241 aa  205  6e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.503632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>