112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3357 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3357  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 351 aa  697    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.825817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02405  periplasmic iron-binding protein  70.85 
 
 		 344 aa  474  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0259  extracellular solute-binding protein  63.79 
 
 		 346 aa  432  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0288  periplasmic iron-binding protein  63.79 
 
 		 346 aa  431  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0161  extracellular solute-binding protein family 1  45.34 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.78 
 
 		 362 aa  239  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  36.84 
 
 		 366 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  36.57 
 
 		 366 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  36.57 
 
 		 366 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  40.35 
 
 		 371 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  36.57 
 
 		 366 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  36.57 
 
 		 366 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.5 
 
 		 362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.5 
 
 		 362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3438  hypothetical protein  41.1 
 
 		 401 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  36.29 
 
 		 366 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  38.3 
 
 		 362 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.5 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  37.5 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  37.5 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  37.5 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  37.31 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  38.32 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4430  periplasmic iron-binding protein  37.65 
 
 		 350 aa  227  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  37.58 
 
 		 365 aa  226  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2934  hypothetical protein  41.82 
 
 		 403 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0059  extracellular solute-binding protein family 1  41.01 
 
 		 370 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1804  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  39.38 
 
 		 354 aa  222  9e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  33.43 
 
 		 362 aa  220  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1375  extracellular solute-binding protein  33.15 
 
 		 362 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0267839  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6109  ABC transporter substrate binding protein (iron)  34.47 
 
 		 374 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2402  hypothetical protein  38.67 
 
 		 365 aa  215  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  34.88 
 
 		 369 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1258  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.43 
 
 		 354 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0059  extracellular solute-binding protein  39.94 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3214  extracellular solute-binding protein family 1  35.76 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2867  extracellular solute-binding protein family 1  35.45 
 
 		 368 aa  212  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3211  extracellular solute-binding protein family 1  40.57 
 
 		 380 aa  209  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1449  extracellular solute-binding protein  39.26 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381136  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2272  hypothetical protein  38.61 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3949  extracellular solute-binding protein  32.48 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3338  putative iron ABC transporter, substrate-binding protein  34.92 
 
 		 354 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2864  extracellular solute-binding protein family 1  39.94 
 
 		 380 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3637  extracellular solute-binding protein family 1  34.69 
 
 		 348 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0309  periplasmic iron-binding protein  33.89 
 
 		 365 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4258  putative iron ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  32.61 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6139  extracellular solute-binding protein  38.04 
 
 		 354 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.160536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3493  extracellular solute-binding protein  38.46 
 
 		 358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685703  normal  0.0583739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2764  extracellular solute-binding protein family 1  39.87 
 
 		 362 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247835  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4161  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  33.23 
 
 		 369 aa  193  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3126  putative periplasmic iron-binding protein  37.96 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2735  putative iron(III) transport system substrate-binding protein  38.06 
 
 		 303 aa  189  7e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0641317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0729  extracellular solute-binding protein  35.09 
 
 		 363 aa  170  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.706674  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4733  putative periplasmic solute-binding protein  36 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2265  extracellular solute-binding protein  22.26 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3159  hypothetical protein  24.21 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 381 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4536  extracellular solute-binding protein  19.14 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.15899  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.78 
 
 		 341 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.78 
 
 		 341 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  25.78 
 
 		 341 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1611  ABC transporter substrate-binding protein  27.11 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.791321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1572  ABC transporter, substrate-binding protein  27.11 
 
 		 341 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1735  ABC transporter substrate-binding protein  27.11 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1948  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113804  normal  0.383853 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1663  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1786  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.11 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1309  putative transporter  26.88 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442575  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4658  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.91 
 
 		 341 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1913  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 348 aa  49.7  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0831866  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.07 
 
 		 341 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4046  putative periplasmic solute-binding protein  24.48 
 
 		 335 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0699034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0340  extracellular solute-binding protein  31.75 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.988078 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2152  putative periplasmic solute-binding protein  24.64 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.123138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0346  ABC transporter, substrate binding protein  24.24 
 
 		 366 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1990  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 366 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2377  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 		 372 aa  46.2  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0307958  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3145  extracellular solute-binding protein  21.88 
 
 		 350 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.47265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4840  putative ABC transporter periplasmic binding component  27.22 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0305994 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3454  putative periplasmic solute-binding protein  25.56 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357351  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1265  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11396  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4501  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.410168  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2587  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  33.98 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2628  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  33.98 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2539  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  33.98 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1703  extracellular solute-binding protein family 1  27.85 
 
 		 398 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2948  ABC transporter substrate binding protein  22.08 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0950  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 366 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5854  hypothetical protein  24.08 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2651  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  31.01 
 
 		 407 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0959912  hitchhiker  0.000467532 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 325 aa  43.9  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21960  hypothetical protein  21.88 
 
 		 352 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000202681 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2833  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>