More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3048 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
331 aa  680    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  62.27 
 
 
333 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  63.19 
 
 
333 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  62.26 
 
 
342 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  62.26 
 
 
877 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  61.73 
 
 
377 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  62.26 
 
 
404 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  62.26 
 
 
404 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  63.14 
 
 
353 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  62.82 
 
 
387 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  62.26 
 
 
441 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  61.76 
 
 
406 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  62.82 
 
 
353 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  62.82 
 
 
353 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  62.26 
 
 
439 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  62.18 
 
 
353 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  62.5 
 
 
352 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  60.65 
 
 
341 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  60.84 
 
 
429 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  61.54 
 
 
352 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  60.45 
 
 
344 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  58.05 
 
 
332 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  60.32 
 
 
387 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  59.94 
 
 
335 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  57.75 
 
 
332 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  57.1 
 
 
332 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  58.93 
 
 
348 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  60.95 
 
 
339 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  58.58 
 
 
348 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  58.71 
 
 
332 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  58.39 
 
 
332 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  55.66 
 
 
341 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  57.32 
 
 
332 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  55.65 
 
 
350 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1396  putative transmembrane protein  59.87 
 
 
355 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  56.23 
 
 
331 aa  368  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  56.69 
 
 
345 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  55.88 
 
 
344 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  56.21 
 
 
344 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  51.62 
 
 
333 aa  315  9e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  54.25 
 
 
368 aa  305  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  47.88 
 
 
331 aa  305  7e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  47.06 
 
 
333 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  46.56 
 
 
330 aa  300  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  47.47 
 
 
381 aa  290  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  44.14 
 
 
329 aa  268  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  45.37 
 
 
346 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  40.24 
 
 
330 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  46.08 
 
 
345 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  38.68 
 
 
336 aa  196  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  38.58 
 
 
336 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  35.37 
 
 
340 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  35.26 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  35.99 
 
 
340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  36 
 
 
334 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.44 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.87 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  29.37 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  27.09 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 
437 aa  76.3  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  27.95 
 
 
276 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  42.7 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  28.38 
 
 
292 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.14 
 
 
293 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  37.19 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.26 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 
431 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.48 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  45 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  32.93 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.31 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  32.93 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  45 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  39.05 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  39.05 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  39.05 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  26.12 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  25.35 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  26.12 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  43.14 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1937  alpha/beta hydrolase fold protein  28.18 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  37.96 
 
 
361 aa  69.3  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  23.27 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  26.24 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>