More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1664 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 209 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0862458  normal  0.0704615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3021  amino acid transporter LysE  61.22 
 
 		 204 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196294  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2724  lysine exporter protein LysE/YggA  62.81 
 
 		 204 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.138868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2658  lysine exporter protein LysE/YggA  60.71 
 
 		 204 aa  230  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2800  lysine exporter protein LysE/YggA  61.86 
 
 		 204 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208295  normal  0.25716 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1905  lysine exporter protein LysE/YggA  50.24 
 
 		 215 aa  214  7e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1841  lysine exporter protein LysE/YggA  47 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000006365 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0042  lysine exporter protein LysE/YggA  48.15 
 
 		 216 aa  148  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1550  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.71 
 
 		 225 aa  144  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2912  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.67 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4142  lysine exporter protein LysE/YggA  38.42 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000225003  hitchhiker  0.0000840644 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  34.95 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2400  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.94 
 
 		 214 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.954989  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4855  transporter, LysE family  38.76 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4781  transporter LysE family  38.28 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.917767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  30.93 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.06 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  30.58 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6117  hypothetical protein  35.1 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  28.37 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1462  lysine exporter protein LysE/YggA  34.5 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  28.43 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  29.53 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70510  hypothetical protein  34.62 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  31.19 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1663  hypothetical protein  33.5 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.363901  normal  0.119938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4393  lysine exporter protein LysE/YggA  37.37 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  28.57 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  27.54 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  32.04 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.32 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  27.91 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  26.5 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  27.37 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  27.88 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0587  lysine exporter protein LysE/YggA  26.84 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3536  lysine exporter protein LysE/YggA  26.99 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  30.88 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  29.26 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.99 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  28.43 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6693  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.96 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  29.13 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  32.11 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.64 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  27.45 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  27.45 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  27.45 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  31.16 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  27.75 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  27.45 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  27.45 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  27.45 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  27.45 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  27.45 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3366  lysine exporter protein LysE/YggA  26.87 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  29.32 
 
 		 222 aa  72  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  26.96 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  29.13 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  26.01 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  28.57 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  27.09 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  28.57 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  29.65 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  32 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  30.05 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.91 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0689  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.22 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  28.57 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0668  lysine exporter protein LysE/YggA  25.22 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  28.29 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  27.18 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3688  lysine exporter protein LysE/YggA  25.22 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  30.05 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  29.81 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0699  lysine exporter protein LysE/YggA  25.22 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  27.09 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  27.09 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  27.09 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  28.99 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  27.27 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.5 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  26.74 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  29.44 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  29.44 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  29.29 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  31.89 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  29.44 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  28.71 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.67 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  26.46 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  30.43 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  28.22 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  26.6 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  26.6 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0856  lysine exporter protein LysE/YggA  31.07 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.985682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  26.6 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>