More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1082 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
730 aa  1483    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  39.65 
 
 
741 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  37.08 
 
 
766 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03290  TonB-dependent Receptor  64.42 
 
 
337 aa  451  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  36.98 
 
 
693 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  36.98 
 
 
693 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  37.81 
 
 
732 aa  437  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  37.65 
 
 
816 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  35.76 
 
 
802 aa  429  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  36.9 
 
 
814 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  37.06 
 
 
815 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  35.76 
 
 
714 aa  412  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  35.89 
 
 
827 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  35.67 
 
 
696 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  35.95 
 
 
748 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  36.24 
 
 
840 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.75 
 
 
747 aa  395  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  35.87 
 
 
741 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.16 
 
 
728 aa  391  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  33.86 
 
 
808 aa  389  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  35.03 
 
 
803 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  34.29 
 
 
799 aa  389  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  34.35 
 
 
720 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  33.62 
 
 
753 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  35.47 
 
 
741 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  34.84 
 
 
735 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.47 
 
 
724 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.47 
 
 
724 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.47 
 
 
724 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  34.43 
 
 
747 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  33.67 
 
 
753 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.47 
 
 
724 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.15 
 
 
729 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  32.15 
 
 
729 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3531  TonB-dependent siderophore receptor  34.58 
 
 
740 aa  378  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313722  decreased coverage  0.00643483 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.28 
 
 
729 aa  379  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.28 
 
 
729 aa  379  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.15 
 
 
729 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.28 
 
 
729 aa  378  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  32.15 
 
 
729 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.15 
 
 
729 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.15 
 
 
729 aa  379  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  34.48 
 
 
747 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  34.16 
 
 
765 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.33 
 
 
724 aa  376  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  33.56 
 
 
812 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  33.79 
 
 
833 aa  375  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0603  TonB-dependent siderophore receptor  32.34 
 
 
716 aa  375  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00298801  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  34.16 
 
 
765 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0137  TonB-dependent iron-siderophore receptor precursor  31.52 
 
 
721 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  32.62 
 
 
731 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  33.42 
 
 
725 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  33.72 
 
 
765 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  37.37 
 
 
803 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  34.09 
 
 
737 aa  368  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  32.48 
 
 
729 aa  369  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  33.77 
 
 
807 aa  365  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  32.3 
 
 
722 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3097  TonB-dependent siderophore receptor  31.59 
 
 
723 aa  365  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582192  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3064  TonB-dependent siderophore receptor  32.83 
 
 
712 aa  365  1e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  35.68 
 
 
713 aa  365  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  32.8 
 
 
795 aa  362  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  33.61 
 
 
723 aa  362  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  32.52 
 
 
733 aa  360  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 
722 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0540  TonB-dependent siderophore receptor  32.35 
 
 
718 aa  360  6e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 
819 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  33.2 
 
 
789 aa  358  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  34.37 
 
 
841 aa  357  2.9999999999999997e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1517  TonB-dependent siderophore receptor  34.22 
 
 
737 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134645  normal  0.877607 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2136  TonB-dependent siderophore receptor  32.35 
 
 
722 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.503645  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1507  TonB-dependent siderophore receptor  34.55 
 
 
737 aa  357  5e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.681157  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1451  TonB-dependent siderophore receptor  34.22 
 
 
737 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  33.14 
 
 
810 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3033  ferric alcaligin siderophore receptor  35.36 
 
 
700 aa  355  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2339  TonB-dependent siderophore receptor  32.21 
 
 
722 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000312883  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  33.14 
 
 
817 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  32.34 
 
 
723 aa  355  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3717  TonB-dependent siderophore receptor  31.53 
 
 
726 aa  355  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  33.62 
 
 
824 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  32.2 
 
 
798 aa  353  5.9999999999999994e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  32.18 
 
 
699 aa  353  7e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  35.2 
 
 
720 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 
806 aa  351  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  33.15 
 
 
801 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  32.61 
 
 
703 aa  349  9e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  34.31 
 
 
727 aa  349  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  34.13 
 
 
738 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  34.13 
 
 
738 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2724  FhuE receptor  31.46 
 
 
707 aa  348  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  32.41 
 
 
724 aa  347  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  32.42 
 
 
812 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  33.47 
 
 
826 aa  340  8e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  34.69 
 
 
747 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  33.1 
 
 
745 aa  335  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  33.8 
 
 
844 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  34.05 
 
 
836 aa  331  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  33.97 
 
 
752 aa  330  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  32.66 
 
 
822 aa  328  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  30.83 
 
 
802 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>