More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6736 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6736  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 226 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.973659  normal  0.523736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4553  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.47 
 
 		 227 aa  287  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.130056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6964  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.27 
 
 		 226 aa  275  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.043471  normal  0.107802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0465  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 225 aa  246  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2732  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0720  DNA-binding response regulator  48.64 
 
 		 229 aa  231  7.000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4882  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 		 224 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4933  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.742602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3534  two-component system response regulator  44.55 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2586  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 227 aa  214  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3158  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1332  response regulator receiver  46.19 
 
 		 224 aa  210  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2540  response regulator receiver  43.86 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1449  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3049  two component transcriptional regulator  47.73 
 
 		 224 aa  201  9e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.39 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.39 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5580  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1620  two component transcriptional regulator  34.09 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0142  DNA-binding response regulator  38.7 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2454  transcriptional regulator domain protein  31.82 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.02572  normal  0.811367 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.65 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  35.14 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1185  response regulator receiver  33.48 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 406 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.48 
 
 		 233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  35.84 
 
 		 223 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.39 
 
 		 225 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.29 
 
 		 224 aa  144  8.000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.39 
 
 		 225 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 233 aa  144  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  36.94 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  36.2 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  35.59 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.65 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  35.91 
 
 		 652 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  33.78 
 
 		 224 aa  142  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.39 
 
 		 226 aa  141  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 223 aa  141  8e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.14 
 
 		 226 aa  141  8e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  36.77 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  34.55 
 
 		 283 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0289  two component transcriptional regulator  35.53 
 
 		 243 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.563834 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1845  DNA-binding response regulator  35.4 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.07 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1433  two component transcriptional regulator  34.53 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  37.99 
 
 		 230 aa  138  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  35.84 
 
 		 229 aa  138  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  34.68 
 
 		 240 aa  138  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4920  DNA-binding response regulator  36.96 
 
 		 229 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4565  DNA-binding response regulator  36.96 
 
 		 233 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1407  two component transcriptional regulator  34.55 
 
 		 265 aa  137  8.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4803  DNA-binding response regulator  36.96 
 
 		 229 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 239 aa  137  8.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4400  DNA-binding response regulator  36.96 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  34.19 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4417  DNA-binding response regulator  36.96 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.65 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  35.27 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  36.2 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.27 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  33.03 
 
 		 799 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  35.56 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  35.71 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  32.58 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1810  DNA-binding response regulator  33.78 
 
 		 233 aa  136  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0562957  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3419  two component transcriptional regulator  34.22 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  34.68 
 
 		 244 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001205  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  34.68 
 
 		 248 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04992  positive response regulator for pho regulon  33.48 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  33.91 
 
 		 252 aa  135  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1490  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.88 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  36.12 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5331  transcriptional regulator two components regulatory system  34.39 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0274603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0485  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  34.36 
 
 		 244 aa  135  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  33.33 
 
 		 236 aa  135  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1841  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0207334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4786  DNA-binding response regulator  36.52 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5423  two component transcriptional regulator  34.93 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.27 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  35.06 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.67 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  35.06 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1205  two component transcriptional regulator  35.75 
 
 		 222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  34.08 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  32.27 
 
 		 220 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  34.08 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  34.08 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>