189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5899 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5899  Methyltransferase type 11  100 
 
 
230 aa  474  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331708  normal  0.516672 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08180  methyltransferase family protein  30.53 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0397  Methyltransferase type 12  30.85 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0388  Methyltransferase type 12  30.85 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0944  methyltransferase type 12  34.59 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242439  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1427  methyltransferase type 12  30 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4115  methyltransferase type 12  27.04 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  27.88 
 
 
237 aa  75.1  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0847  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.988937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  26.88 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
519 aa  71.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  24.73 
 
 
531 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0533  type 12 methyltransferase  25.49 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324241  decreased coverage  0.00341349 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  25.14 
 
 
527 aa  68.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  31.76 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  31.34 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  25.14 
 
 
527 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  29.05 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  30.28 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  30.28 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  30.28 
 
 
248 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  34.83 
 
 
292 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  29.58 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
240 aa  63.2  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 
274 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  36.26 
 
 
263 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  34.57 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  24.77 
 
 
276 aa  58.5  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  28.67 
 
 
261 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1380  hypothetical protein  29.49 
 
 
236 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  34.15 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  32.14 
 
 
249 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  26 
 
 
239 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  24.83 
 
 
288 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  32.17 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  32.26 
 
 
311 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2661  hypothetical protein  23.48 
 
 
261 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588792  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  28.36 
 
 
237 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 
249 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  28.89 
 
 
249 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  28.4 
 
 
336 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4625  hypothetical protein  28.57 
 
 
237 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394037  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1003  hypothetical protein  27.82 
 
 
237 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1485  hypothetical protein  27.82 
 
 
237 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1461  hypothetical protein  27.82 
 
 
237 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321475  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1757  methylase  28.57 
 
 
240 aa  51.6  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  24.58 
 
 
248 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  24.16 
 
 
289 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
249 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  25.61 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0431  methyltransferase type 11  25.22 
 
 
257 aa  49.7  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.336271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1390  SAM-binding motif-containing protein  30 
 
 
252 aa  49.3  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  32.43 
 
 
223 aa  49.3  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  24.85 
 
 
251 aa  49.3  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  28.37 
 
 
258 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1899  methyltransferase type 11  28.17 
 
 
248 aa  48.9  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.749926 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  30.19 
 
 
318 aa  48.9  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
238 aa  48.5  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 
274 aa  48.5  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
251 aa  48.5  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  24.56 
 
 
255 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0916  methyltransferase type 11  25.83 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 
246 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1408  hypothetical protein  27.82 
 
 
237 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  23.95 
 
 
300 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  28.09 
 
 
243 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  29.8 
 
 
274 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
254 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2762  putative methyltransferase  25.76 
 
 
288 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1368  hypothetical protein  27.82 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.17 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  28.66 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  24.84 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4680  methyltransferase type 11  24.84 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  22.73 
 
 
288 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2992  methyltransferase type 11  25.5 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.547914  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  29.6 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  25.71 
 
 
254 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2551  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 
248 aa  46.2  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  27.96 
 
 
194 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  25.41 
 
 
349 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  27.11 
 
 
217 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 
853 aa  45.4  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805076  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  21.49 
 
 
511 aa  45.4  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  23.18 
 
 
210 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  25.14 
 
 
330 aa  45.4  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  25.53 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  27.08 
 
 
1124 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2893  methyltransferase type 11  25 
 
 
317 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.79 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0633091  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0189  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24.84 
 
 
275 aa  44.7  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.23 
 
 
201 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.37 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.81 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28603  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1353  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
280 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0337053  hitchhiker  0.000000492717 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1911  hypothetical protein  25.77 
 
 
234 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
750 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  25.77 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>