More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5898 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5898  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
358 aa  725    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115502  normal  0.433986 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3671  3-isopropylmalate dehydrogenase  78.93 
 
 
356 aa  592  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  71.55 
 
 
359 aa  536  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1304  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.97 
 
 
351 aa  405  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0585  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.22 
 
 
369 aa  394  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0320977  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.56 
 
 
362 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3428  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.73 
 
 
352 aa  389  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.95 
 
 
357 aa  385  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3900  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.02 
 
 
373 aa  386  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2487  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.69 
 
 
352 aa  378  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.82 
 
 
355 aa  372  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1546  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.52 
 
 
373 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178342  normal  0.073036 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.41 
 
 
355 aa  373  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.19 
 
 
357 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3744  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.56 
 
 
360 aa  373  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.29 
 
 
358 aa  374  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.59 
 
 
358 aa  371  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1958  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.94 
 
 
367 aa  368  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.08 
 
 
357 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.04 
 
 
358 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.61 
 
 
356 aa  371  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.63 
 
 
357 aa  365  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.76 
 
 
357 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.21 
 
 
350 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.61 
 
 
356 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.22 
 
 
354 aa  365  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.13 
 
 
371 aa  364  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0788  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.97 
 
 
357 aa  364  2e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487359  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.71 
 
 
356 aa  364  2e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.2 
 
 
352 aa  362  4e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2226  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.65 
 
 
359 aa  362  5.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.08 
 
 
373 aa  362  6e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.26 
 
 
356 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.97 
 
 
357 aa  360  2e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2864  3-isopropylmalate dehydrogenase  52 
 
 
372 aa  360  3e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.020128  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.56 
 
 
371 aa  359  4e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1047  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.62 
 
 
357 aa  358  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09751  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.75 
 
 
360 aa  357  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.945321  hitchhiker  0.00220334 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.84 
 
 
358 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04390  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.96 
 
 
375 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.930022 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.12 
 
 
358 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.12 
 
 
358 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.86 
 
 
359 aa  355  5e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.94 
 
 
353 aa  355  5.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1420  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.21 
 
 
362 aa  355  5.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.9 
 
 
359 aa  354  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0017  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.81 
 
 
355 aa  355  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.22 
 
 
357 aa  353  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.2 
 
 
357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.52 
 
 
356 aa  352  5e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1677  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.38 
 
 
367 aa  352  5.9999999999999994e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.38 
 
 
355 aa  352  7e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.52 
 
 
360 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.99 
 
 
355 aa  351  1e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.3 
 
 
363 aa  350  1e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.38 
 
 
360 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0740  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 
353 aa  350  2e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1085  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.4 
 
 
348 aa  350  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1781  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.38 
 
 
359 aa  349  3e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.500834  hitchhiker  0.00494446 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 
379 aa  349  5e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197257  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.03 
 
 
357 aa  348  8e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.55 
 
 
360 aa  347  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1100  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.65 
 
 
363 aa  347  1e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.757445  normal  0.166084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.66 
 
 
360 aa  347  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.1 
 
 
360 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1014  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 
362 aa  347  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2472  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.52 
 
 
355 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1221  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.52 
 
 
357 aa  347  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0144759 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17341  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.58 
 
 
357 aa  347  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.25 
 
 
357 aa  346  4e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2311  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.25 
 
 
355 aa  345  6e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1865  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.28 
 
 
357 aa  344  1e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.436203  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1793  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.52 
 
 
356 aa  344  1e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1720  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.44 
 
 
353 aa  344  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.424747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.97 
 
 
360 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.97 
 
 
363 aa  343  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.97 
 
 
360 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.97 
 
 
360 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3548  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.63 
 
 
341 aa  343  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1754  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.33 
 
 
354 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.994905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.97 
 
 
360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3041  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.21 
 
 
356 aa  343  4e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.73 
 
 
357 aa  343  4e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3358  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.18 
 
 
360 aa  342  4e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0745  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.68 
 
 
365 aa  342  5.999999999999999e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000247717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.03 
 
 
360 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1410  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.9 
 
 
367 aa  341  1e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.531545  normal  0.584251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5238  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.69 
 
 
356 aa  340  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.86 
 
 
360 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1054  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.63 
 
 
356 aa  340  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0739  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.17 
 
 
362 aa  340  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379297  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.86 
 
 
359 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0767  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.08 
 
 
356 aa  339  4e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2917  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.95 
 
 
364 aa  339  5e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.34 
 
 
357 aa  338  7e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2162  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.83 
 
 
363 aa  338  8e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.48 
 
 
360 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1819  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 
356 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7246  normal  0.707373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2143  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.14 
 
 
356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444097  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2252  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.42 
 
 
357 aa  337  2.9999999999999997e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>