More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5785 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5785  Ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 95 aa  187  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0742289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4345  Ribosomal protein L25/L23  63.83 
 
 		 95 aa  123  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000178584  normal  0.183841 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0604  Ribosomal protein L25/L23  54.17 
 
 		 96 aa  102  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3160  50S ribosomal protein L23  51.58 
 
 		 95 aa  97.1  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0195  50S ribosomal protein L23  48.42 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05725  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 96 aa  84  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  51.58 
 
 		 95 aa  83.6  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1617  Ribosomal protein L25/L23  45.26 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  45.74 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1936  50S ribosomal protein L23  42.27 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  47.87 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0395  50S ribosomal protein L23  45.83 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0291  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  45.65 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0182  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 		 103 aa  76.6  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000184382  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  45.05 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  47.83 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2421  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00215934  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1849  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 		 103 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.310449  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  44.57 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2227  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000627291  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  46.74 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  45.26 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2062  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000372125  normal  0.225776 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1793  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346044  normal  0.0641385 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  43.48 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  45.56 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  45.65 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  44.19 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0844  Ribosomal protein L25/L23  42.71 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  42.53 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  43.48 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0400  Ribosomal protein L25/L23  43.53 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  43.62 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  40.86 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  44.57 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0662  50S ribosomal protein L23  45.65 
 
 		 96 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  46.15 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  43.62 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  45.65 
 
 		 101 aa  66.6  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  41.94 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  43.62 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  41.49 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  45.65 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  45.05 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  41.49 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  40.43 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  39.78 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  45.56 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  39.78 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  39.78 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  41.3 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  42.39 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2294  50S ribosomal protein L23  38.46 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0336822  normal  0.0105282 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  40.66 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  40.66 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  37.63 
 
 		 100 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  41.49 
 
 		 98 aa  63.5  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  38.04 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  42.86 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  42.53 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  43.48 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  44.83 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4003  Ribosomal protein L25/L23  38.1 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.68966 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  42.53 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  40.66 
 
 		 95 aa  63.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0278  50S ribosomal protein L23  41.49 
 
 		 98 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  44.32 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  38.04 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  44.32 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3993  Ribosomal protein L25/L23  41.11 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  38.95 
 
 		 113 aa  62  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0668  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142276  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0700  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000143862  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000032639  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  41.05 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  39.56 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  43.48 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2772  50S ribosomal protein L23  43.96 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0118683  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  41.11 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  45.26 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  41.11 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  34.07 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  34.07 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  40.43 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>