More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1617 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1617  Ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 99 aa  197  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0604  Ribosomal protein L25/L23  52.63 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1936  50S ribosomal protein L23  53.68 
 
 		 97 aa  100  8e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0395  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 		 96 aa  98.2  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0195  50S ribosomal protein L23  54.26 
 
 		 95 aa  93.6  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3160  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 		 95 aa  93.6  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05725  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  46.32 
 
 		 100 aa  88.2  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0844  Ribosomal protein L25/L23  46.88 
 
 		 100 aa  87  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2294  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0336822  normal  0.0105282 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2227  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000627291  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5785  Ribosomal protein L25/L23  45.26 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0742289 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  43.01 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0182  50S ribosomal protein L23  39.58 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000184382  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2062  50S ribosomal protein L23  43.16 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000372125  normal  0.225776 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0291  50S ribosomal protein L23  40.22 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4345  Ribosomal protein L25/L23  43.62 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000178584  normal  0.183841 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  51.06 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2421  50S ribosomal protein L23  41.67 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00215934  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  44.68 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  46.88 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  49.46 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  39.58 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  39.36 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  41.3 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1849  50S ribosomal protein L23  40.62 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.310449  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  45.83 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  40.4 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  46.39 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  43.43 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  40.4 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  41.41 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  42.71 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2255  50S ribosomal protein L23  42.42 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000014312  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  37.23 
 
 		 97 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  37.23 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  43.16 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  37.23 
 
 		 97 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  43.43 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  43.43 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0194  Ribosomal protein L25/L23  43.3 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1149  Ribosomal protein L25/L23  45.74 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000523481  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1348  50S ribosomal protein L23  41.67 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  38.54 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  36.17 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  39.18 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  41.3 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  43.16 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0662  50S ribosomal protein L23  37.37 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  43.43 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  43.01 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  45.74 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  45.74 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  44.68 
 
 		 97 aa  70.1  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  41.05 
 
 		 100 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  37.89 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  38.78 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  38.78 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  42.86 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  38.95 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  41.05 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000032639  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  37.89 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  40 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  42.42 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0849  50S ribosomal protein L23P  40.62 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000828313  decreased coverage  0.0000112275 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  39.6 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  45.74 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  37.89 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  43.01 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  45.16 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  40 
 
 		 99 aa  67  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  39.58 
 
 		 94 aa  67  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  39.58 
 
 		 94 aa  67  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  40.62 
 
 		 94 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  45.26 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2063  50S ribosomal protein L23  41.41 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000000993724  normal  0.203735 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  35.71 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  44.21 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  36.56 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1763  50S ribosomal protein L23  40.4 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00961532  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0760  50S ribosomal protein L23  46.59 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000631754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>