More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0400 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0400  Ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 98 aa  191  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  53.41 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  52.87 
 
 		 100 aa  87.8  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 99 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  49.43 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  48.89 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  45.83 
 
 		 100 aa  84.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  52.27 
 
 		 103 aa  83.6  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 		 96 aa  83.6  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  48.86 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  49.44 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  52.63 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3756  Ribosomal protein L25/L23  47.31 
 
 		 101 aa  80.1  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  48.86 
 
 		 100 aa  80.1  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  44.57 
 
 		 98 aa  80.1  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  46.81 
 
 		 93 aa  78.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  45.26 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  45.74 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  55.38 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  46.74 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 		 100 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  45.26 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  44.57 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  47.87 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  53.03 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1125  Ribosomal protein L25/L23  54.55 
 
 		 98 aa  76.6  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  43.75 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  47.73 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  44.09 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  47.73 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  43.3 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  48.86 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  45.16 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  47.37 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  47.37 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1042  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1015  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1032  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  47.37 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  47.37 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  46.32 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  46.32 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1187  Ribosomal protein L25/L23  53.03 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.102596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5047  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185864  normal  0.262037 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  46.32 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  43.16 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  44.44 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0668  50S ribosomal protein L23  45.26 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142276  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0700  50S ribosomal protein L23  45.26 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000143862  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  42.71 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  45.26 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  47.62 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  44.44 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2905  Ribosomal protein L25/L23  44.21 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  48.42 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  47.25 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1251  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.781143  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  46.32 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  47.37 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  45.26 
 
 		 111 aa  70.1  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  47.37 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  45.65 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  44.33 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  43.62 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  41.24 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  38.95 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  44.94 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0491  50S ribosomal protein L23  43.16 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310283  hitchhiker  0.00323784 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0486  50S ribosomal protein L23  43.16 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000945976  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  44.33 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5785  Ribosomal protein L25/L23  43.53 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0742289 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  44.94 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  47.67 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  40 
 
 		 93 aa  67  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  44.21 
 
 		 97 aa  67  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  46.67 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  48.28 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  42.27 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  42.27 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0428  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291057  decreased coverage  0.00000564548 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  46.67 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>