More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4505 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 100 aa  200  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  76.04 
 
 		 98 aa  150  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  77.66 
 
 		 98 aa  149  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  75.79 
 
 		 101 aa  147  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  72.92 
 
 		 98 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  71.88 
 
 		 96 aa  140  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  65.98 
 
 		 100 aa  138  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  71.28 
 
 		 99 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  68.75 
 
 		 96 aa  137  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  73.2 
 
 		 99 aa  136  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  65.98 
 
 		 100 aa  136  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  66.34 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  67.68 
 
 		 100 aa  135  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  71.58 
 
 		 100 aa  131  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  66.33 
 
 		 100 aa  130  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1042  50S ribosomal protein L23  62.63 
 
 		 100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1015  50S ribosomal protein L23  62.63 
 
 		 100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1032  50S ribosomal protein L23  62.63 
 
 		 100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  66.32 
 
 		 101 aa  128  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  67.02 
 
 		 103 aa  128  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  66.32 
 
 		 100 aa  127  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  66.33 
 
 		 103 aa  127  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  67.01 
 
 		 100 aa  127  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  63.64 
 
 		 101 aa  126  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  63.64 
 
 		 101 aa  126  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  62.63 
 
 		 100 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  67.37 
 
 		 100 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5047  50S ribosomal protein L23  62.63 
 
 		 100 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185864  normal  0.262037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  64.29 
 
 		 111 aa  124  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3756  Ribosomal protein L25/L23  64.89 
 
 		 101 aa  123  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  64.95 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  62.77 
 
 		 107 aa  120  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  60.82 
 
 		 101 aa  118  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  59.79 
 
 		 100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1125  Ribosomal protein L25/L23  56.7 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1187  Ribosomal protein L25/L23  58 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.102596 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  56.7 
 
 		 98 aa  107  8.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  53.61 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  58.51 
 
 		 98 aa  102  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  57.89 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  53.12 
 
 		 96 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  57.14 
 
 		 95 aa  101  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  53.26 
 
 		 94 aa  98.6  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  53.76 
 
 		 94 aa  98.2  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  49.47 
 
 		 96 aa  98.2  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 95 aa  96.7  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 98 aa  94  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  52.17 
 
 		 97 aa  94  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  52.17 
 
 		 97 aa  94  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  49.47 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  51.58 
 
 		 98 aa  92  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  51.58 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  54.26 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  49.46 
 
 		 94 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  46.81 
 
 		 95 aa  90.1  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  53.41 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2905  Ribosomal protein L25/L23  47.37 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  51.06 
 
 		 99 aa  85.9  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  51.09 
 
 		 99 aa  84.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  54.55 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  44.68 
 
 		 93 aa  85.1  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  53.41 
 
 		 100 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  48.42 
 
 		 98 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  53.41 
 
 		 100 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0400  Ribosomal protein L25/L23  45.83 
 
 		 98 aa  84.7  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  41.67 
 
 		 99 aa  84  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 		 94 aa  83.6  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  46.24 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  50 
 
 		 93 aa  82.8  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  52.17 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1356  ribosomal protein L25/L23  47.92 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.385939  normal  0.0499735 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  46.59 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  47.37 
 
 		 99 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1351  50S ribosomal protein L23  51.11 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  48.45 
 
 		 97 aa  80.1  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 99 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0578  Ribosomal protein L25/L23  47.78 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  47.37 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  48.86 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  51.11 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0856  50S ribosomal protein L23  51.11 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483725  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  47.37 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  45.45 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  47.73 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  45.65 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  47.42 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>