More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2905 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2905  Ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 96 aa  197  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  77.08 
 
 		 96 aa  152  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  57.78 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  49.47 
 
 		 96 aa  101  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  48.42 
 
 		 95 aa  100  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  52.63 
 
 		 95 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  49.45 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  49.47 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  55.68 
 
 		 100 aa  92.8  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  49.46 
 
 		 100 aa  91.3  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  49.46 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 		 101 aa  90.1  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  53.49 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 		 97 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 		 97 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  49.43 
 
 		 96 aa  87.8  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  54.12 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1042  50S ribosomal protein L23  54.12 
 
 		 100 aa  87.4  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1015  50S ribosomal protein L23  54.12 
 
 		 100 aa  87.4  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1032  50S ribosomal protein L23  54.12 
 
 		 100 aa  87.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  49.43 
 
 		 98 aa  87  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 		 98 aa  87  8e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  47.37 
 
 		 100 aa  86.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  54.44 
 
 		 99 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  52.87 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5047  50S ribosomal protein L23  52.94 
 
 		 100 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185864  normal  0.262037 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  54.65 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  49.43 
 
 		 99 aa  85.1  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  47.31 
 
 		 99 aa  85.1  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  46.88 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  48.84 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  52.56 
 
 		 98 aa  84.3  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  54.65 
 
 		 100 aa  84.3  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  46.67 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  51.76 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  51.76 
 
 		 100 aa  84  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  49.43 
 
 		 96 aa  83.6  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  51.16 
 
 		 101 aa  83.6  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 		 94 aa  83.6  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  51.16 
 
 		 101 aa  83.6  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  53.75 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  51.16 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  45.26 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  51.76 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  52.56 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  51.72 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000031737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  51.11 
 
 		 98 aa  80.1  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0760  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000631754  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  45.83 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  44.21 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3756  Ribosomal protein L25/L23  46.81 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  45.83 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  47.06 
 
 		 100 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  46.59 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  45.88 
 
 		 100 aa  76.6  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 98 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  45.88 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  45.26 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3642  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101067  hitchhiker  0.0000000000169859 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  48.86 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  44.71 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  45.88 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0316  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000511744  decreased coverage  0.00276856 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  45.24 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  45.65 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  45.05 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  48.45 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  46.91 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  46.91 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2838  50S ribosomal protein L23  51.16 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000238806  normal  0.241874 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1793  50S ribosomal protein L23  43.96 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346044  normal  0.0641385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0456  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0420406  unclonable  0.000000164588 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0489  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000019112  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  43.96 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  43.53 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0486  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00438289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4747  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000334762  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>