More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29720 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  100 
 
 		 101 aa  201  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  89.9 
 
 		 100 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  85.26 
 
 		 103 aa  171  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  83.84 
 
 		 100 aa  170  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  80.41 
 
 		 107 aa  166  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  80 
 
 		 103 aa  164  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  72.28 
 
 		 101 aa  159  9e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  72.28 
 
 		 101 aa  159  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  72.28 
 
 		 101 aa  159  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  73.74 
 
 		 100 aa  157  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  78.79 
 
 		 101 aa  154  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  77.08 
 
 		 100 aa  153  7e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  76.92 
 
 		 96 aa  142  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  70.87 
 
 		 103 aa  142  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  75.82 
 
 		 99 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  75.82 
 
 		 96 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  72.34 
 
 		 100 aa  135  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  69.79 
 
 		 99 aa  134  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  67.37 
 
 		 98 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3756  Ribosomal protein L25/L23  65.98 
 
 		 101 aa  131  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1042  50S ribosomal protein L23  68.09 
 
 		 100 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1015  50S ribosomal protein L23  68.09 
 
 		 100 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1032  50S ribosomal protein L23  68.09 
 
 		 100 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  62.63 
 
 		 103 aa  128  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  66.32 
 
 		 100 aa  128  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  65.69 
 
 		 100 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  65.69 
 
 		 100 aa  126  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5047  50S ribosomal protein L23  67.02 
 
 		 100 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185864  normal  0.262037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  72.83 
 
 		 100 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  63.27 
 
 		 111 aa  126  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  67.02 
 
 		 100 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  71.74 
 
 		 100 aa  125  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  65.59 
 
 		 98 aa  125  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  61.29 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1125  Ribosomal protein L25/L23  68.09 
 
 		 98 aa  118  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1187  Ribosomal protein L25/L23  58.25 
 
 		 104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.102596 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  56.38 
 
 		 98 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  54.17 
 
 		 98 aa  106  9.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  60.22 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  58.06 
 
 		 95 aa  99.4  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  52.69 
 
 		 95 aa  97.8  5e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  53.26 
 
 		 94 aa  97.1  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  54.74 
 
 		 97 aa  94.4  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  51.09 
 
 		 94 aa  94.7  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  56.67 
 
 		 95 aa  94.4  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  53.76 
 
 		 96 aa  93.6  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  53.76 
 
 		 95 aa  93.6  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  52.17 
 
 		 95 aa  93.6  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  54.44 
 
 		 91 aa  92  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  52.69 
 
 		 95 aa  90.9  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  52.22 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  52.22 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  53.19 
 
 		 96 aa  90.1  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  47.83 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  47.83 
 
 		 95 aa  89.4  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 		 97 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 		 97 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  52.33 
 
 		 96 aa  86.7  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2905  Ribosomal protein L25/L23  52.87 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0400  Ribosomal protein L25/L23  49.43 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  48.35 
 
 		 93 aa  85.5  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 98 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 		 99 aa  83.6  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2062  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000372125  normal  0.225776 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  43.01 
 
 		 99 aa  79.7  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  48.91 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  49.44 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  45.83 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  47.56 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  47.73 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  46.94 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  46.94 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  47.25 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  44.79 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  46.59 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  46.59 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1793  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346044  normal  0.0641385 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0856  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0760  50S ribosomal protein L23  48.75 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000631754  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>