More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0288 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  100 
 
 
94 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  69.57 
 
 
95 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  66.3 
 
 
95 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  63.83 
 
 
94 aa  120  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  59.14 
 
 
95 aa  110  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  56.99 
 
 
95 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  60 
 
 
96 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
97 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
97 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  58.95 
 
 
97 aa  103  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  55.79 
 
 
95 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  54.35 
 
 
101 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  54.44 
 
 
96 aa  100  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  54.84 
 
 
95 aa  100  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  53.85 
 
 
98 aa  99.4  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  54.35 
 
 
100 aa  98.6  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  54.35 
 
 
100 aa  98.2  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  53.26 
 
 
103 aa  97.1  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  53.26 
 
 
101 aa  97.1  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  53.33 
 
 
99 aa  96.7  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 
94 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  51.61 
 
 
94 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  52.17 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  53.33 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  54.44 
 
 
95 aa  94.7  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  55.32 
 
 
96 aa  95.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  56.32 
 
 
94 aa  94.7  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  54.44 
 
 
98 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  53.85 
 
 
100 aa  92.8  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  48.89 
 
 
96 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
96 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  56.52 
 
 
95 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
96 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000031737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
96 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
96 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
96 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
96 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
96 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  51.09 
 
 
100 aa  91.3  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
96 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
96 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  49.46 
 
 
100 aa  91.3  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  51.09 
 
 
95 aa  90.9  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  46.74 
 
 
98 aa  91.3  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 
100 aa  91.3  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  46.74 
 
 
98 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
96 aa  90.5  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  51.11 
 
 
93 aa  90.1  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  51.09 
 
 
100 aa  90.1  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  52.69 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  52.33 
 
 
97 aa  88.6  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  55.43 
 
 
95 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  50.51 
 
 
99 aa  89  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 
96 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  48.42 
 
 
95 aa  88.6  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  48.39 
 
 
93 aa  88.2  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  52.08 
 
 
98 aa  88.2  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  44.68 
 
 
98 aa  87.8  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  53.33 
 
 
97 aa  88.2  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  53.68 
 
 
96 aa  87.8  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  50.55 
 
 
91 aa  87.8  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  53.85 
 
 
98 aa  87.8  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 
101 aa  87.4  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  55.81 
 
 
111 aa  87.4  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  45.56 
 
 
98 aa  87.4  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  53.33 
 
 
104 aa  87  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  49.46 
 
 
99 aa  87  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  50.54 
 
 
103 aa  87  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 
101 aa  86.7  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 
101 aa  86.7  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  46.74 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  47.83 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  48.91 
 
 
98 aa  86.3  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  52.17 
 
 
95 aa  86.7  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1042  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 
100 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  52.22 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 
100 aa  85.5  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
98 aa  85.5  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1015  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 
100 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_419  ribosomal protein L23  45.74 
 
 
94 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0245207  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0453  50S ribosomal protein L23  45.74 
 
 
94 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00013155  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  52.22 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  53.33 
 
 
98 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1032  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 
100 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  53.33 
 
 
98 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  50.52 
 
 
111 aa  84.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 
94 aa  85.1  3e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0585  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
98 aa  85.1  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.720688 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  51.11 
 
 
97 aa  84.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  50.57 
 
 
100 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  53.26 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  51.72 
 
 
100 aa  85.5  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0278  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
98 aa  84.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  50.57 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 
95 aa  84.3  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5047  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185864  normal  0.262037 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  52.22 
 
 
98 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  52.22 
 
 
98 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>