More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2617 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 96 aa  197  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2905  Ribosomal protein L25/L23  77.08 
 
 		 96 aa  152  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  53.68 
 
 		 95 aa  111  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  57.61 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  53.68 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  56.84 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  57.14 
 
 		 94 aa  104  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  56.67 
 
 		 98 aa  99  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  52.63 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  51.58 
 
 		 95 aa  97.4  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  52.75 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  54.02 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  52.75 
 
 		 100 aa  92  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  51.58 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  48.96 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  49.46 
 
 		 97 aa  91.3  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  49.46 
 
 		 97 aa  91.3  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  55.56 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  52.27 
 
 		 100 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1042  50S ribosomal protein L23  54.12 
 
 		 100 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1015  50S ribosomal protein L23  54.12 
 
 		 100 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1032  50S ribosomal protein L23  54.12 
 
 		 100 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  52.81 
 
 		 98 aa  88.6  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5047  50S ribosomal protein L23  54.12 
 
 		 100 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185864  normal  0.262037 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  50.55 
 
 		 98 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  52.94 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  54.65 
 
 		 98 aa  88.2  4e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  51.72 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  52.33 
 
 		 96 aa  87.8  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  55.81 
 
 		 100 aa  87.4  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 		 98 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  48.98 
 
 		 101 aa  87.4  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  52.94 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 		 94 aa  86.7  9e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  52.33 
 
 		 101 aa  86.7  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  54.12 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  53.49 
 
 		 100 aa  85.5  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  54.35 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  52.94 
 
 		 100 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  51.16 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 		 94 aa  84.7  3e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  51.72 
 
 		 99 aa  84.3  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  50.54 
 
 		 95 aa  84  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  54.32 
 
 		 111 aa  84  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 		 95 aa  83.6  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  51.16 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  53.01 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  48.86 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  51.76 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3756  Ribosomal protein L25/L23  45.74 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  50.59 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  45.16 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  47.25 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  45.88 
 
 		 95 aa  80.1  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  51.11 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  48.24 
 
 		 93 aa  79.7  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  48.19 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0760  50S ribosomal protein L23  50.6 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000631754  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  46.43 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  46.32 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2561  Ribosomal protein L25/L23  46.99 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1793  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346044  normal  0.0641385 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  49.38 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  46.74 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  47.73 
 
 		 100 aa  77.4  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3907  50S ribosomal protein L23  51.16 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.104737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000031737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  44.79 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1125  Ribosomal protein L25/L23  48.39 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4003  Ribosomal protein L25/L23  43.12 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.68966 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  47.78 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  48.42 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  44.21 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  48.91 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  42.71 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  43.01 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  47.06 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  47.06 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0628  ribosomal protein L23  50 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000267442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4546  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215144  normal  0.061023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5077  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000053863  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0400  Ribosomal protein L25/L23  43.16 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  46.88 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>