More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0694 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  100 
 
 		 94 aa  186  1e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  78.72 
 
 		 94 aa  157  5e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  51.11 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  48.28 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  52.94 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  50.59 
 
 		 98 aa  88.2  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  51.11 
 
 		 95 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  52.44 
 
 		 97 aa  87.4  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf441  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 		 181 aa  86.7  1e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  47.78 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  50.59 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  50.59 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  46.81 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1348  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  46.51 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  48.28 
 
 		 97 aa  84.7  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 		 98 aa  84  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 		 95 aa  83.6  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  47.73 
 
 		 96 aa  83.6  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  44.44 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  50.57 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  45.56 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  47.87 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  46.07 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  45.45 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  45.45 
 
 		 96 aa  80.1  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  48.86 
 
 		 100 aa  80.1  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  48.31 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  42.86 
 
 		 96 aa  80.1  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947106  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  43.68 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  43.82 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  42.39 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  42.39 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  41.3 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2905  Ribosomal protein L25/L23  40 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1015  50S ribosomal protein L23  46.99 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1042  50S ribosomal protein L23  46.99 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  42.39 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1032  50S ribosomal protein L23  46.99 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  44.32 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0194  Ribosomal protein L25/L23  48.31 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  48.19 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  45.56 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  47.56 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  46.59 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  46.34 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0329  50S ribosomal protein L23  44.71 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1617  Ribosomal protein L25/L23  44.44 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0499  50S ribosomal protein L23  44.71 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.173851  hitchhiker  0.00000000336824 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  43.18 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000032639  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  34.78 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  34.78 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  34.78 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  45.78 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  43.18 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  36.96 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5047  50S ribosomal protein L23  45.78 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185864  normal  0.262037 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  38.37 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  50.62 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0849  50S ribosomal protein L23P  43.48 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000828313  decreased coverage  0.0000112275 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  45.24 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  42.05 
 
 		 100 aa  73.6  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  46.91 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  41.67 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  41.3 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  41.86 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  38.64 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  48.15 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  48.72 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  43.18 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  37.23 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  40.22 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  43.68 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  48.15 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  40.91 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  41.86 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  45.68 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  41.86 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  47.73 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  44.32 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>