More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0964 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  100 
 
 
93 aa  190  6e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  82.8 
 
 
95 aa  161  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  80.65 
 
 
95 aa  158  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  60.64 
 
 
99 aa  117  7e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  59.14 
 
 
96 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  59.77 
 
 
98 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  58.24 
 
 
95 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  56.04 
 
 
93 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  50.54 
 
 
99 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  53.68 
 
 
101 aa  98.2  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  53.33 
 
 
98 aa  97.4  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 
94 aa  96.7  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  55.43 
 
 
95 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  50.55 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  55.43 
 
 
95 aa  95.9  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  48.91 
 
 
100 aa  93.2  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 
98 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  50.54 
 
 
100 aa  91.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  50.54 
 
 
100 aa  90.5  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1125  Ribosomal protein L25/L23  50.53 
 
 
98 aa  90.9  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  51.11 
 
 
94 aa  90.1  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  45.65 
 
 
101 aa  90.1  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 
98 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  47.83 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  53.19 
 
 
97 aa  89.4  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 
94 aa  89  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  48.91 
 
 
101 aa  89  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  48.39 
 
 
96 aa  89.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  52.38 
 
 
98 aa  89  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 
95 aa  89.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  51.61 
 
 
95 aa  89.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 
94 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 
98 aa  87.4  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 
100 aa  87  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  54.76 
 
 
100 aa  87  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  54.76 
 
 
100 aa  87  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  46.74 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  48.91 
 
 
100 aa  86.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
98 aa  86.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  47.37 
 
 
111 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3756  Ribosomal protein L25/L23  47.83 
 
 
101 aa  85.5  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 
96 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  45.65 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  50 
 
 
98 aa  85.5  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 
110 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1187  Ribosomal protein L25/L23  51.69 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.102596 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  51.11 
 
 
96 aa  85.1  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  44.68 
 
 
100 aa  85.1  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3993  Ribosomal protein L25/L23  54.55 
 
 
94 aa  84.3  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  45.65 
 
 
103 aa  84  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  45.74 
 
 
100 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  49.46 
 
 
96 aa  83.6  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  43.48 
 
 
107 aa  83.6  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  49.46 
 
 
96 aa  83.6  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  45.16 
 
 
95 aa  83.2  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  43.48 
 
 
100 aa  82.8  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 
94 aa  83.2  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  42.86 
 
 
98 aa  82.8  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  45.65 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  48.91 
 
 
100 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
96 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
96 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000031737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
96 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
96 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
96 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
96 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
96 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1015  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 
100 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1042  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 
100 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
96 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1032  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 
100 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
96 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  47.73 
 
 
94 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 
97 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 
97 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 
100 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 
100 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 
97 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  48.91 
 
 
95 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 
95 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000032639  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  42.53 
 
 
94 aa  80.1  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 
101 aa  80.5  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 
97 aa  80.5  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 
101 aa  80.5  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5047  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 
100 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185864  normal  0.262037 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 
91 aa  79.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05725  50S ribosomal protein L23  44.21 
 
 
96 aa  80.1  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 
91 aa  79.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  50.55 
 
 
91 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  45.92 
 
 
99 aa  79.3  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 
97 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  51.16 
 
 
98 aa  79  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  46.59 
 
 
94 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947106  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 
98 aa  79  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
95 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  44.32 
 
 
94 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0400  Ribosomal protein L25/L23  46.81 
 
 
98 aa  78.6  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>