More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1522 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 94 aa  185  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  71.43 
 
 		 95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  68.13 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  63.83 
 
 		 94 aa  120  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  58.06 
 
 		 95 aa  116  9e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  58.24 
 
 		 96 aa  110  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  60 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  58.89 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  57.14 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  57.14 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  57.58 
 
 		 99 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  53.76 
 
 		 94 aa  104  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  57.14 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  56.04 
 
 		 100 aa  103  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  59.09 
 
 		 94 aa  102  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  55.56 
 
 		 98 aa  102  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  56.99 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 		 101 aa  100  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  55.56 
 
 		 98 aa  99.8  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  53.76 
 
 		 100 aa  98.2  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  52.22 
 
 		 96 aa  98.6  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  57.89 
 
 		 97 aa  98.6  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  52.58 
 
 		 111 aa  97.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  54.44 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 		 98 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  51.61 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  51.61 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2905  Ribosomal protein L25/L23  49.45 
 
 		 96 aa  96.3  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 100 aa  94.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  51.09 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  52.17 
 
 		 100 aa  94.4  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  54.84 
 
 		 93 aa  94.7  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  52.17 
 
 		 100 aa  94.7  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  53.85 
 
 		 98 aa  94.4  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  55.06 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  55.06 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  48.91 
 
 		 98 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 99 aa  94  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  52.22 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  55.91 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  56.04 
 
 		 97 aa  92.8  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  51.61 
 
 		 94 aa  92  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  57.14 
 
 		 97 aa  92.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  57.14 
 
 		 97 aa  92.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  47.87 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  56.04 
 
 		 97 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  51.14 
 
 		 98 aa  92  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  50.54 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  51.09 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  51.61 
 
 		 99 aa  90.9  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1042  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 		 100 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  56.04 
 
 		 98 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1015  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 		 100 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1032  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 		 100 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  52.17 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  54.95 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 		 101 aa  88.6  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  52.75 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  54.95 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  56.04 
 
 		 98 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5047  50S ribosomal protein L23  52.17 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185864  normal  0.262037 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 		 98 aa  89.4  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  53.33 
 
 		 95 aa  88.6  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  55.43 
 
 		 95 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  54.95 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  51.58 
 
 		 95 aa  87.8  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  54.95 
 
 		 98 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  55.43 
 
 		 95 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  51.72 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1793  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 		 98 aa  87  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346044  normal  0.0641385 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  51.72 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 		 97 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  49.48 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  48.39 
 
 		 99 aa  86.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3756  Ribosomal protein L25/L23  48.39 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 		 97 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  47.83 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  52.22 
 
 		 95 aa  84.7  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2561  Ribosomal protein L25/L23  46.51 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  50.55 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  49.45 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 		 99 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1125  Ribosomal protein L25/L23  48.94 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  48.24 
 
 		 104 aa  83.6  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  50.55 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>