More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1294 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  100 
 
 
100 aa  196  9e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  100 
 
 
100 aa  196  9e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  70.83 
 
 
101 aa  131  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1136  ribosomal protein L25/L23  60 
 
 
100 aa  111  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000719358  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  59.55 
 
 
98 aa  108  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  45.16 
 
 
98 aa  97.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  54.84 
 
 
94 aa  96.3  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  52.69 
 
 
98 aa  95.9  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  56.25 
 
 
93 aa  93.6  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  48.94 
 
 
95 aa  92  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 
97 aa  89.7  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  54.76 
 
 
95 aa  89.4  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  54.12 
 
 
94 aa  87.8  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  55 
 
 
96 aa  87.4  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  51.22 
 
 
97 aa  87  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  54.76 
 
 
93 aa  87  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  57.65 
 
 
99 aa  86.7  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 
95 aa  86.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  54.32 
 
 
91 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  54.32 
 
 
91 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  47.87 
 
 
95 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  53.57 
 
 
95 aa  85.5  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  51.76 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  58.97 
 
 
95 aa  84.3  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  50.57 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 
98 aa  84.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  53.93 
 
 
95 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  48.86 
 
 
95 aa  81.3  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 
96 aa  80.9  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  48.39 
 
 
94 aa  80.9  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  56.41 
 
 
95 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  45.24 
 
 
98 aa  79.7  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  50 
 
 
96 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0856  50S ribosomal protein L23  48 
 
 
98 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483725  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  51.69 
 
 
94 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  47.44 
 
 
98 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
97 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
97 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  51.69 
 
 
98 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  49.46 
 
 
98 aa  78.6  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  49.46 
 
 
94 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  51.11 
 
 
98 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 
94 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
96 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  48.19 
 
 
98 aa  77.4  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  48.72 
 
 
96 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  48.72 
 
 
96 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000031737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  48.72 
 
 
96 aa  77  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  48.72 
 
 
96 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  48.72 
 
 
96 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  48.72 
 
 
96 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  48.72 
 
 
96 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  48.72 
 
 
96 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  48.72 
 
 
96 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_002936  DET0476  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
94 aa  77  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00880639  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  46.67 
 
 
96 aa  76.6  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  55.42 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0453  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 
94 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00013155  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  51.69 
 
 
98 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  49.4 
 
 
98 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2370  ribosomal protein L23  46.67 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_419  ribosomal protein L23  47.31 
 
 
94 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0245207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  48.15 
 
 
96 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 
98 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2322  50S ribosomal protein L23  47.62 
 
 
98 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000334931  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0194  Ribosomal protein L25/L23  48.39 
 
 
94 aa  75.9  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
99 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  51.16 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 
98 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  49.37 
 
 
99 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  46.91 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  51.16 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  45.68 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  45.92 
 
 
99 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 
94 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0055  50S ribosomal protein L23  51.14 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233404  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  45.12 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0849  50S ribosomal protein L23P  44.94 
 
 
99 aa  74.7  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000828313  decreased coverage  0.0000112275 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  44.44 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 
96 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 
95 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  48.28 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  48.28 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  46.91 
 
 
100 aa  73.9  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 
100 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  45.68 
 
 
101 aa  73.9  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2255  50S ribosomal protein L23  43.16 
 
 
96 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000014312  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  44.09 
 
 
98 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0597  50S ribosomal protein L23P  47.56 
 
 
99 aa  73.6  0.0000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000650952  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  44.44 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0052  50S ribosomal protein L23  51.19 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000136053  hitchhiker  3.59649e-24 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  51.11 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>