More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0983 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 95 aa  187  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  50.54 
 
 		 95 aa  98.6  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  51.58 
 
 		 95 aa  98.2  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  56.67 
 
 		 98 aa  97.8  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  54.26 
 
 		 95 aa  97.1  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  52.63 
 
 		 96 aa  94.4  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  49.46 
 
 		 94 aa  94  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  52.69 
 
 		 95 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  54.65 
 
 		 95 aa  92  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000031737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  51.04 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  52.63 
 
 		 95 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 		 96 aa  90.5  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  46.81 
 
 		 95 aa  90.5  7e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 		 94 aa  90.5  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  51.06 
 
 		 98 aa  90.1  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 96 aa  89.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  52.69 
 
 		 95 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  51.25 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  56.25 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  51.25 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  51.25 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  52.22 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  47.31 
 
 		 99 aa  83.6  8e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  48.91 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  45.16 
 
 		 93 aa  83.2  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  49.46 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  50.52 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  48.86 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  48.86 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  51.58 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  48.84 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 		 96 aa  80.1  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  55.06 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  52.81 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2905  Ribosomal protein L25/L23  44.21 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  44.44 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  45.65 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  42.39 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  43.96 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  48.91 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  48.91 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  45.92 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  42.39 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  42.39 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  43.62 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  44.21 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  43.16 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  46.24 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  46.94 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  46.24 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  43.96 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1136  ribosomal protein L25/L23  45.26 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000719358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  45.65 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  40.86 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4003  Ribosomal protein L25/L23  44.04 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.68966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  43.16 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  41.11 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  45.45 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  40.45 
 
 		 98 aa  72  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  45.26 
 
 		 98 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  45.88 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  45.26 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  45.74 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  47.67 
 
 		 95 aa  72  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  45.26 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  44.68 
 
 		 103 aa  72  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3177  50S ribosomal protein L23  44.19 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000279852  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1187  Ribosomal protein L25/L23  47.56 
 
 		 104 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.102596 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  41.94 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  44.09 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  46.81 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  45.26 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3315  50S ribosomal protein L23  44.19 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  45.26 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1793  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346044  normal  0.0641385 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  43.62 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>