More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2153 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  100 
 
 		 95 aa  193  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  67.03 
 
 		 98 aa  120  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  60 
 
 		 98 aa  118  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  63.44 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  58.51 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  58.51 
 
 		 94 aa  111  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  61.54 
 
 		 95 aa  110  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  56.38 
 
 		 96 aa  110  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  58.24 
 
 		 93 aa  105  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  60.42 
 
 		 97 aa  103  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  55.79 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  55.43 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  56.7 
 
 		 98 aa  101  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  56 
 
 		 99 aa  98.2  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  52.13 
 
 		 93 aa  97.1  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  54.26 
 
 		 95 aa  97.1  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  54.26 
 
 		 95 aa  97.1  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  56.25 
 
 		 96 aa  97.1  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  56.04 
 
 		 96 aa  96.3  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 		 100 aa  96.7  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  55.32 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  53.68 
 
 		 95 aa  95.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  56.04 
 
 		 99 aa  94.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  51.09 
 
 		 99 aa  94.7  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  53.85 
 
 		 100 aa  94.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  53.76 
 
 		 101 aa  93.6  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  58.7 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 		 100 aa  92  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 		 100 aa  92  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  55.21 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000032639  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  53.76 
 
 		 100 aa  92  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1136  ribosomal protein L25/L23  58.51 
 
 		 100 aa  91.7  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000719358  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  53.76 
 
 		 100 aa  91.3  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  54.26 
 
 		 100 aa  91.3  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1763  50S ribosomal protein L23  55.21 
 
 		 96 aa  90.1  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00961532  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  50.55 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  53.85 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  52.69 
 
 		 98 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  52.75 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  51.61 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  51.61 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  55.32 
 
 		 95 aa  87.8  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  51.58 
 
 		 94 aa  87.8  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 		 96 aa  87.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 		 101 aa  87  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  54.26 
 
 		 101 aa  86.7  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  53.26 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  50.54 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0081  50S ribosomal protein L23  52.08 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3993  Ribosomal protein L25/L23  52.69 
 
 		 94 aa  84.7  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  54.02 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  47.31 
 
 		 100 aa  84.7  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000031737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  49.46 
 
 		 98 aa  84.7  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  54.17 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  52.87 
 
 		 100 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  51.72 
 
 		 100 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  50.54 
 
 		 96 aa  84  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  52.87 
 
 		 100 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  49.47 
 
 		 97 aa  84  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  51.61 
 
 		 98 aa  84  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 96 aa  83.6  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05725  50S ribosomal protein L23  44.21 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  49.47 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf441  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2255  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000014312  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  51.61 
 
 		 100 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  46.74 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0479  Ribosomal protein L25/L23  46.74 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  51.61 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2421  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00215934  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  51.61 
 
 		 100 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0856  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 		 98 aa  81.3  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483725  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  53.12 
 
 		 98 aa  81.3  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  49.43 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  50.56 
 
 		 98 aa  81.3  0.000000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2227  50S ribosomal protein L23  46.74 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000627291  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  49.43 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  47.25 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_419  ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0245207  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  49.46 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  48.28 
 
 		 100 aa  80.1  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>