More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0769 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  100 
 
 
94 aa  188  2.9999999999999997e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  54.95 
 
 
98 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  54.95 
 
 
98 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  54.84 
 
 
100 aa  96.3  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  52.22 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  54.84 
 
 
100 aa  96.3  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  48.39 
 
 
98 aa  95.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 
98 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  52.08 
 
 
98 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  51.61 
 
 
94 aa  92  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  53.85 
 
 
98 aa  92  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 
98 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 
98 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  49.45 
 
 
98 aa  89.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  54.02 
 
 
94 aa  89  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  50 
 
 
95 aa  89  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 
99 aa  87.4  5e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 
94 aa  87  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 
94 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  52.08 
 
 
101 aa  86.7  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  48.91 
 
 
101 aa  86.3  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  44.83 
 
 
95 aa  85.5  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  47.96 
 
 
99 aa  85.5  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  49.43 
 
 
99 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  47.83 
 
 
96 aa  85.1  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  47.31 
 
 
93 aa  85.1  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  46.74 
 
 
95 aa  84.3  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1136  ribosomal protein L25/L23  54.84 
 
 
100 aa  83.6  8e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000719358  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  44.32 
 
 
98 aa  83.2  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  49.43 
 
 
96 aa  83.6  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  49.46 
 
 
94 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0962  50S ribosomal protein L23  51.19 
 
 
98 aa  82  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000402083  hitchhiker  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  48.31 
 
 
101 aa  82  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  44.44 
 
 
96 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  43.68 
 
 
95 aa  82  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  44.32 
 
 
98 aa  81.3  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 
97 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 
97 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 
95 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  47.13 
 
 
98 aa  80.9  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 
97 aa  80.9  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 
97 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  46.59 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 
97 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 
97 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0423  50S ribosomal protein L23P  48.31 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0123777  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 
97 aa  80.5  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1251  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 
100 aa  80.5  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.781143  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  49.44 
 
 
100 aa  80.5  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  46.67 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  42.53 
 
 
93 aa  80.1  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0456  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 
99 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0420406  unclonable  0.000000164588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0486  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 
99 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00438289  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0489  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 
99 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000019112  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4747  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 
99 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000334762  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 
96 aa  80.1  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 
98 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 
101 aa  79.7  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 
97 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 
97 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 
98 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  47.78 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 
95 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0758  50S ribosomal protein L23  45.35 
 
 
99 aa  79  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156644  normal  0.0173378 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 
98 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 
99 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0435  50S ribosomal protein L23  46.51 
 
 
100 aa  78.2  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00486251  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2370  ribosomal protein L23  47.25 
 
 
97 aa  78.2  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 
97 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 
97 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  43.02 
 
 
97 aa  78.2  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0499  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.173851  hitchhiker  0.00000000336824 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0329  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3907  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.104737  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1793  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346044  normal  0.0641385 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0496  50S ribosomal protein L23  45.35 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000003402  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 
99 aa  77  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06270  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 
99 aa  77  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219554  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0194  Ribosomal protein L25/L23  49.44 
 
 
94 aa  77  0.00000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  45.65 
 
 
98 aa  77  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2322  50S ribosomal protein L23  45.35 
 
 
98 aa  76.6  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000334931  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 
102 aa  76.6  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  47.19 
 
 
100 aa  76.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  44.44 
 
 
100 aa  76.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  46.15 
 
 
100 aa  76.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  47.19 
 
 
103 aa  76.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0297  ribosomal L23 protein  44.44 
 
 
98 aa  75.9  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000230523  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  45.98 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2772  50S ribosomal protein L23  47.37 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0118683  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 
99 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4003  Ribosomal protein L25/L23  47.06 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.68966 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1763  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00961532  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0668  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142276  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0700  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000143862  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1351  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0400  Ribosomal protein L25/L23  44.94 
 
 
98 aa  74.7  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>