More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0227 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 95 aa  187  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  68.13 
 
 		 94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  66.3 
 
 		 94 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  67.37 
 
 		 95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  56.84 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  55.79 
 
 		 96 aa  106  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  60.44 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  59.77 
 
 		 96 aa  102  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  58.43 
 
 		 101 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  55.79 
 
 		 95 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  57.14 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  54.35 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  54.35 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  57.47 
 
 		 96 aa  97.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  60 
 
 		 100 aa  97.8  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  54.55 
 
 		 98 aa  97.4  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  51.58 
 
 		 96 aa  97.4  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  52.81 
 
 		 98 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  56.25 
 
 		 96 aa  96.3  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  53.93 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  56.04 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  56.67 
 
 		 101 aa  94.4  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 		 94 aa  94.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 		 98 aa  94.4  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  57.78 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  51.55 
 
 		 99 aa  93.6  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  50.56 
 
 		 98 aa  93.6  9e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  58.7 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  56.32 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  52.04 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  55.06 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  52.27 
 
 		 99 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  54.55 
 
 		 100 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 		 94 aa  90.5  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  56.82 
 
 		 100 aa  90.5  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  54.35 
 
 		 94 aa  90.1  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  56.99 
 
 		 97 aa  90.1  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  55.56 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  55.56 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  51.11 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  51.69 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  52.75 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  51.69 
 
 		 100 aa  87.8  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1042  50S ribosomal protein L23  54.55 
 
 		 100 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1015  50S ribosomal protein L23  54.55 
 
 		 100 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1032  50S ribosomal protein L23  54.55 
 
 		 100 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  49.44 
 
 		 95 aa  87.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  51.06 
 
 		 101 aa  87  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  51.06 
 
 		 101 aa  87  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  50.55 
 
 		 98 aa  87  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1763  50S ribosomal protein L23  57.14 
 
 		 96 aa  87  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00961532  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  51.69 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  50.54 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  53.85 
 
 		 100 aa  85.5  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5047  50S ribosomal protein L23  54.55 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185864  normal  0.262037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  53.93 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0081  50S ribosomal protein L23  55.43 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  53.26 
 
 		 95 aa  84.3  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  45.56 
 
 		 105 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  47.37 
 
 		 98 aa  83.6  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  51.69 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3756  Ribosomal protein L25/L23  52.22 
 
 		 101 aa  82.8  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1793  50S ribosomal protein L23  50.55 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346044  normal  0.0641385 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2561  Ribosomal protein L25/L23  46.51 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  48.45 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  52.22 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  51.81 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  47.83 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  45.56 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  53.93 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 		 100 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 		 100 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  48.91 
 
 		 93 aa  81.3  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  51.58 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2905  Ribosomal protein L25/L23  45.26 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  45.35 
 
 		 97 aa  81.3  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  51.06 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0662  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 		 96 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  45.16 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0604  Ribosomal protein L25/L23  41.67 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  45.98 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  45.12 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  45.98 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  48.31 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  45.56 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1617  Ribosomal protein L25/L23  46.88 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2255  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000014312  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  46.43 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  48.94 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  46.15 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>