More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1793 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1793  50S ribosomal protein L23  100 
 
 		 98 aa  197  6e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346044  normal  0.0641385 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  75.51 
 
 		 98 aa  147  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  66.33 
 
 		 98 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  65.59 
 
 		 104 aa  124  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0278  50S ribosomal protein L23  64.29 
 
 		 98 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  68.82 
 
 		 97 aa  123  9e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  68.82 
 
 		 97 aa  123  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  68.82 
 
 		 97 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  68.82 
 
 		 97 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  68.82 
 
 		 97 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  65.31 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  67.74 
 
 		 97 aa  121  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  65.31 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  66.67 
 
 		 97 aa  121  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  64.29 
 
 		 98 aa  120  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  66.67 
 
 		 97 aa  119  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  64.29 
 
 		 98 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  63.27 
 
 		 98 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  64.29 
 
 		 98 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  66.3 
 
 		 96 aa  118  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  65.96 
 
 		 102 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1351  50S ribosomal protein L23  65.59 
 
 		 104 aa  116  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1356  ribosomal protein L25/L23  65.96 
 
 		 103 aa  114  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.385939  normal  0.0499735 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1251  50S ribosomal protein L23  64.52 
 
 		 100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.781143  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0585  50S ribosomal protein L23  61.22 
 
 		 98 aa  114  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.720688 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0668  50S ribosomal protein L23  61.29 
 
 		 97 aa  114  5e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142276  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0700  50S ribosomal protein L23  61.29 
 
 		 97 aa  114  5e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000143862  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  61.22 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  61.86 
 
 		 99 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  60.82 
 
 		 99 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  60.2 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  60.82 
 
 		 99 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0578  Ribosomal protein L25/L23  60.2 
 
 		 102 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0761  50S ribosomal protein L23  59.18 
 
 		 98 aa  110  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679128  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  61.29 
 
 		 99 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  60.22 
 
 		 99 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  61.54 
 
 		 113 aa  103  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1681  50S ribosomal protein L23  61.29 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0570438  hitchhiker  0.0000115816 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  58.24 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1718  50S ribosomal protein L23  60.2 
 
 		 98 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0786377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0363  50S ribosomal protein L23  60.2 
 
 		 98 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.674139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2532  50S ribosomal protein L23  60.2 
 
 		 98 aa  96.7  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  51.72 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  53.33 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  52.69 
 
 		 99 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 		 101 aa  87.4  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  51.65 
 
 		 94 aa  87  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  51.06 
 
 		 99 aa  87  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  50.57 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0856  50S ribosomal protein L23  52.69 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483725  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  51.11 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  51.72 
 
 		 100 aa  84.7  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  48.89 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  55.17 
 
 		 94 aa  83.6  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  50.55 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  50.54 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  48.28 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  50.55 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  50.55 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0849  50S ribosomal protein L23P  45.56 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000828313  decreased coverage  0.0000112275 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0758  50S ribosomal protein L23  45.83 
 
 		 99 aa  80.5  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156644  normal  0.0173378 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  51.11 
 
 		 98 aa  80.1  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0061  50S ribosomal protein L23  48.98 
 
 		 101 aa  80.1  0.000000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000105028  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  49.44 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  46.81 
 
 		 98 aa  80.1  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0871  50S ribosomal protein L23  52.81 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  50.57 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  50.57 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  52.22 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  52.81 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  48.31 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  50.57 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  48.35 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  51.69 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0428  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291057  decreased coverage  0.00000564548 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  49.44 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2322  ribosomal L23 protein  52.87 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0297  ribosomal L23 protein  47.19 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000230523  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  45.26 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  48.91 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06270  50S ribosomal protein L23  52.22 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219554  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0172  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243767  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  50 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3522  ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000457129  hitchhiker  0.00000622944 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0499  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.173851  hitchhiker  0.00000000336824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  48.89 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3295  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000040814  hitchhiker  0.0000223362 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2948  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000296107  hitchhiker  0.000000753496 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0150  50S ribosomal protein L23  51.61 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125205  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0329  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0233  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0407  50S ribosomal protein L23P  47.31 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000028308  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0202  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000251497  unclonable  0.00000770372 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4054  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000001282  unclonable  0.00000000000566696 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3757  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228479  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2905  Ribosomal protein L25/L23  43.96 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>