More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0217 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  100 
 
 
95 aa  184  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  71.43 
 
 
94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  63.16 
 
 
96 aa  127  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  65.26 
 
 
95 aa  127  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  69.57 
 
 
94 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  67.37 
 
 
95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  61.96 
 
 
96 aa  114  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  61.05 
 
 
95 aa  114  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  61.46 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  58.7 
 
 
97 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  58.7 
 
 
97 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  56.52 
 
 
94 aa  110  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  63.44 
 
 
100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  58.7 
 
 
99 aa  107  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  59.14 
 
 
101 aa  107  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  57.61 
 
 
96 aa  107  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  58.06 
 
 
100 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  59.78 
 
 
94 aa  106  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  59.14 
 
 
100 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  55.43 
 
 
94 aa  105  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  60.22 
 
 
103 aa  106  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  56.84 
 
 
96 aa  106  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  60.64 
 
 
95 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  60.22 
 
 
100 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  56.52 
 
 
95 aa  105  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  60.22 
 
 
101 aa  104  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  58.7 
 
 
95 aa  104  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  60.22 
 
 
103 aa  103  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  55.43 
 
 
93 aa  103  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  56.38 
 
 
95 aa  103  7e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  60.44 
 
 
107 aa  103  9e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  60.87 
 
 
97 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  58.51 
 
 
95 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  56.99 
 
 
100 aa  102  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  55.56 
 
 
98 aa  102  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
98 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 
98 aa  101  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  57.29 
 
 
96 aa  100  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  57.29 
 
 
96 aa  100  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  57.29 
 
 
96 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  57.29 
 
 
96 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000031737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  57.29 
 
 
96 aa  100  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  57.29 
 
 
96 aa  100  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  57.29 
 
 
96 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  57.29 
 
 
96 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  57.29 
 
 
96 aa  100  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  58.33 
 
 
96 aa  100  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  54.74 
 
 
100 aa  99.8  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2905  Ribosomal protein L25/L23  52.63 
 
 
96 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  57.89 
 
 
103 aa  99.4  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  56.38 
 
 
101 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  56.38 
 
 
101 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  54.84 
 
 
101 aa  98.6  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  55.21 
 
 
96 aa  98.6  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  52.22 
 
 
98 aa  98.2  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  58.24 
 
 
98 aa  97.8  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  55.67 
 
 
98 aa  97.1  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  55.32 
 
 
100 aa  95.9  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  55.43 
 
 
93 aa  96.7  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  60.23 
 
 
91 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  60.23 
 
 
91 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  55.32 
 
 
95 aa  95.5  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  52.13 
 
 
100 aa  94.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  57.14 
 
 
99 aa  94.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  52.13 
 
 
100 aa  94  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1015  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 
100 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1032  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 
100 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1042  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 
100 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  57.95 
 
 
91 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1187  Ribosomal protein L25/L23  54.64 
 
 
104 aa  93.2  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.102596 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1793  50S ribosomal protein L23  53.33 
 
 
98 aa  92.8  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346044  normal  0.0641385 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  51.61 
 
 
100 aa  92  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  50.54 
 
 
98 aa  92  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  56.67 
 
 
98 aa  92.4  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5047  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185864  normal  0.262037 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  51.61 
 
 
103 aa  92  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  52.69 
 
 
110 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 
100 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  54.44 
 
 
98 aa  90.9  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  52.69 
 
 
99 aa  90.9  6e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  54.64 
 
 
97 aa  90.5  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  52.63 
 
 
95 aa  90.5  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  51.58 
 
 
98 aa  90.5  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3756  Ribosomal protein L25/L23  50.54 
 
 
101 aa  90.1  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  53.76 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  54.17 
 
 
111 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  51.11 
 
 
94 aa  87.8  5e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 
98 aa  87.8  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  52.22 
 
 
94 aa  87  8e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  51.06 
 
 
100 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  51.06 
 
 
100 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  55.43 
 
 
94 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  52.87 
 
 
100 aa  85.9  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  51.11 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  51.72 
 
 
100 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  51.72 
 
 
100 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0760  50S ribosomal protein L23  53.01 
 
 
117 aa  85.5  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000631754  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  52.22 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  56.67 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  50.57 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>