More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1183 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  100 
 
 		 94 aa  195  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  94.68 
 
 		 94 aa  183  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  75.82 
 
 		 94 aa  146  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  61.46 
 
 		 98 aa  119  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  58.51 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  58.7 
 
 		 95 aa  110  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  55.43 
 
 		 95 aa  105  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  56.04 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  58.7 
 
 		 96 aa  103  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  55.56 
 
 		 99 aa  101  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  52.69 
 
 		 97 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  52.69 
 
 		 97 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  54.26 
 
 		 94 aa  99  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  51.11 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  52.69 
 
 		 96 aa  99  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  53.76 
 
 		 94 aa  98.6  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  54.26 
 
 		 97 aa  97.4  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  52.75 
 
 		 98 aa  97.1  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  55.81 
 
 		 100 aa  97.1  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  54.65 
 
 		 100 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  51.61 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  50.54 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  54.65 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  50.54 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  54.65 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  54.65 
 
 		 100 aa  94.7  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  52.17 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  52.81 
 
 		 95 aa  94.4  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  53.49 
 
 		 100 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  54.65 
 
 		 100 aa  94  6e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  48.39 
 
 		 93 aa  92.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  52.69 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  54.65 
 
 		 100 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 		 95 aa  92  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_419  ribosomal protein L23  47.31 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0245207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  51.61 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000032639  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  53.85 
 
 		 97 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  53.85 
 
 		 97 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0453  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 		 94 aa  91.3  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00013155  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  49.45 
 
 		 95 aa  90.5  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  46.24 
 
 		 98 aa  90.9  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0476  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 		 94 aa  90.5  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00880639  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  53.49 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  53.49 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  53.26 
 
 		 97 aa  90.5  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  48.35 
 
 		 99 aa  90.5  8e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 96 aa  89.4  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  53.33 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  53.33 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  52.22 
 
 		 98 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  51.06 
 
 		 97 aa  90.1  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  48.89 
 
 		 93 aa  89  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  46.74 
 
 		 95 aa  89.4  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  48.89 
 
 		 99 aa  89  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  54.76 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  52.81 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1348  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  50.6 
 
 		 101 aa  88.6  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  48.35 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 		 91 aa  87.4  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  54.02 
 
 		 96 aa  87.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 		 97 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  51.76 
 
 		 97 aa  87.4  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0849  50S ribosomal protein L23P  48.89 
 
 		 99 aa  87.4  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000828313  decreased coverage  0.0000112275 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 		 101 aa  87  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  51.16 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 		 94 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947106  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  51.16 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 		 100 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4003  Ribosomal protein L25/L23  48.57 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.68966 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 		 100 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 		 100 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  51.11 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 		 97 aa  84.3  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 		 97 aa  84.3  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 		 98 aa  84  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 		 97 aa  84  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 		 97 aa  83.6  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  45.16 
 
 		 100 aa  83.6  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 		 99 aa  83.6  9e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0479  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 102 aa  83.6  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  46.07 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  45.56 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  46.67 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  45.65 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>