More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3010 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  100 
 
 
101 aa  200  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  60 
 
 
105 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  57 
 
 
110 aa  120  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2561  Ribosomal protein L25/L23  58.42 
 
 
104 aa  120  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  55.88 
 
 
104 aa  119  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  57.14 
 
 
100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  57.14 
 
 
100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  56.25 
 
 
100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  53.54 
 
 
103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  53.54 
 
 
103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  57.14 
 
 
100 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  56.12 
 
 
100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  56.57 
 
 
100 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  54.55 
 
 
100 aa  110  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  56.99 
 
 
97 aa  110  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  54.84 
 
 
100 aa  110  9e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  53.76 
 
 
100 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  52.69 
 
 
100 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  52.38 
 
 
95 aa  95.9  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
97 aa  90.9  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
94 aa  89.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  50.6 
 
 
94 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  51.85 
 
 
95 aa  88.2  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 
98 aa  87.8  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  48.86 
 
 
95 aa  87.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 
95 aa  87  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  49.4 
 
 
94 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
98 aa  85.9  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  46.91 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  46.91 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  46.51 
 
 
94 aa  84.7  4e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  46.59 
 
 
95 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  48.78 
 
 
98 aa  84  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  45.68 
 
 
91 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 
98 aa  82.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  47.13 
 
 
94 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  47.19 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  47.37 
 
 
98 aa  81.3  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 
98 aa  79.7  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  46.51 
 
 
94 aa  79.7  0.00000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
98 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  45.98 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 
98 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  50 
 
 
96 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
98 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  43.02 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 
96 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
97 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
97 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  48.84 
 
 
101 aa  77.4  0.00000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  46.43 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  43.02 
 
 
98 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  51.76 
 
 
96 aa  77  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  46.34 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  46.34 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000031737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  46.34 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  46.34 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  46.34 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  46.34 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  46.34 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  46.34 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  46.34 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  46.34 
 
 
96 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  43.53 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  46.34 
 
 
96 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  46.59 
 
 
103 aa  76.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 
98 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 
98 aa  75.9  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  43.53 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 
101 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  43.53 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  47.62 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  47.06 
 
 
95 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  44.57 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  48.28 
 
 
96 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  43.96 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  47.25 
 
 
100 aa  73.9  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  42.35 
 
 
97 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  49.41 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  46.07 
 
 
96 aa  73.6  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  41.49 
 
 
98 aa  73.6  0.0000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  45.12 
 
 
95 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  45.24 
 
 
97 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  45.12 
 
 
95 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  38.54 
 
 
100 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  46.43 
 
 
99 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0578  Ribosomal protein L25/L23  46.81 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0194  Ribosomal protein L25/L23  45.45 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  38.54 
 
 
100 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  45 
 
 
93 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  45.88 
 
 
101 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  46.43 
 
 
94 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
98 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  46.15 
 
 
100 aa  72  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  45.88 
 
 
101 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>