More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3665 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 99 aa  201  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  57.3 
 
 		 98 aa  103  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  55.43 
 
 		 97 aa  100  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  56.18 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  53.26 
 
 		 96 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  53.26 
 
 		 96 aa  98.6  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000031737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  53.26 
 
 		 96 aa  98.6  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  53.26 
 
 		 96 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  53.26 
 
 		 96 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  53.26 
 
 		 96 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  53.26 
 
 		 96 aa  98.6  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  53.26 
 
 		 96 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  53.26 
 
 		 96 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  53.26 
 
 		 96 aa  98.2  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  55.06 
 
 		 98 aa  98.6  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  54.35 
 
 		 98 aa  97.8  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  54.35 
 
 		 98 aa  97.1  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  52.17 
 
 		 96 aa  97.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  53.93 
 
 		 93 aa  97.1  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  52.69 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  55.06 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1125  Ribosomal protein L25/L23  46.15 
 
 		 98 aa  92.8  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  50.55 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 		 99 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3756  Ribosomal protein L25/L23  48.35 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  53.33 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  47.25 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  48.96 
 
 		 97 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  48.96 
 
 		 97 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  49.46 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 		 95 aa  88.6  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 		 101 aa  88.2  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  48.39 
 
 		 94 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  48.35 
 
 		 98 aa  85.9  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0597  50S ribosomal protein L23P  50.54 
 
 		 99 aa  85.9  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000650952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  51.09 
 
 		 100 aa  84.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2905  Ribosomal protein L25/L23  47.31 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 		 100 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  46.74 
 
 		 94 aa  84.3  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  48.31 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  46.74 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0844  Ribosomal protein L25/L23  42.55 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  46.74 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  45.83 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1042  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1015  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1032  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5047  50S ribosomal protein L23  45.36 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185864  normal  0.262037 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  50.55 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  49.45 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  47.25 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  52.75 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  45.05 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  49.45 
 
 		 100 aa  80.1  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  46.74 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  44.79 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  43.88 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  42.71 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  45.16 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  43.88 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  43.88 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  45.65 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  46.74 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  44.9 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  49.45 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1187  Ribosomal protein L25/L23  45.65 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.102596 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  48.35 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  47.25 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  45.65 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  44.94 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  43.96 
 
 		 100 aa  77.4  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 100 aa  77.4  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  48.78 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  44.33 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  46.94 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  45.92 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  45.16 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  44.9 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  49.37 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  43.62 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  49.37 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  42.39 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  44.94 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  47.78 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  43.01 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  48.31 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  43.16 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>