More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_01190 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 96 aa  192  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  62.37 
 
 		 95 aa  120  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  59.14 
 
 		 93 aa  115  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  57.89 
 
 		 95 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  61.46 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  56.38 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  57.29 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  55.91 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  58.89 
 
 		 98 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  56.99 
 
 		 100 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  55.91 
 
 		 99 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  55.91 
 
 		 93 aa  106  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  58.06 
 
 		 94 aa  105  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  54.84 
 
 		 96 aa  104  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  54.17 
 
 		 96 aa  103  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  53.12 
 
 		 100 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  53.76 
 
 		 97 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  53.76 
 
 		 97 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  54.84 
 
 		 96 aa  101  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  55.21 
 
 		 95 aa  100  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  53.76 
 
 		 95 aa  100  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  52.69 
 
 		 94 aa  100  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  57.45 
 
 		 101 aa  100  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  53.61 
 
 		 98 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  52.69 
 
 		 94 aa  99  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  54.26 
 
 		 100 aa  98.2  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  54.74 
 
 		 100 aa  97.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  54.64 
 
 		 98 aa  97.4  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  54.74 
 
 		 100 aa  97.4  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  52.22 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  56.25 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  53.68 
 
 		 97 aa  95.9  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 		 97 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 		 97 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  55.32 
 
 		 94 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  54.44 
 
 		 97 aa  94.4  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 		 97 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  50.55 
 
 		 95 aa  94  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4003  Ribosomal protein L25/L23  47.71 
 
 		 109 aa  93.6  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.68966 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  51.02 
 
 		 98 aa  92.8  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  48.42 
 
 		 98 aa  92.8  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  48.96 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  54.26 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  47.87 
 
 		 94 aa  92  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  55.32 
 
 		 100 aa  91.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  48.94 
 
 		 99 aa  91.3  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 97 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  54.26 
 
 		 101 aa  91.7  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  51.04 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0329  50S ribosomal protein L23  45.88 
 
 		 97 aa  90.5  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0499  50S ribosomal protein L23  45.88 
 
 		 97 aa  90.5  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.173851  hitchhiker  0.00000000336824 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 		 94 aa  90.9  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  48.39 
 
 		 98 aa  90.1  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  53.19 
 
 		 101 aa  90.1  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  52.58 
 
 		 111 aa  90.1  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  53.06 
 
 		 97 aa  90.1  9e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  52.08 
 
 		 103 aa  90.1  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  48.94 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 99 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  53.57 
 
 		 117 aa  88.6  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3756  Ribosomal protein L25/L23  47.87 
 
 		 101 aa  88.6  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 		 94 aa  87.8  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947106  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  52.13 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0849  50S ribosomal protein L23P  46.88 
 
 		 99 aa  87.4  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000828313  decreased coverage  0.0000112275 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 96 aa  87.4  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  47.78 
 
 		 99 aa  87.4  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  53.19 
 
 		 100 aa  87.4  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0871  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 100 aa  87  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  43.62 
 
 		 98 aa  87  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  48.28 
 
 		 97 aa  86.7  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  52.13 
 
 		 100 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  45.83 
 
 		 98 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1348  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000032639  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  45.83 
 
 		 98 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  44.79 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  48.45 
 
 		 96 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1187  Ribosomal protein L25/L23  54.08 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.102596 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2905  Ribosomal protein L25/L23  46.88 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  45.26 
 
 		 100 aa  84.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  45.26 
 
 		 100 aa  84.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0471  50S ribosomal protein L23  52.81 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000395002  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  51.09 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  46.39 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1125  Ribosomal protein L25/L23  47.42 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 95 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 		 102 aa  84.3  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  46.74 
 
 		 98 aa  84  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  49.47 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  49.47 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0061  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 		 101 aa  84  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000105028  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 		 100 aa  83.6  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000248684  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 		 100 aa  83.6  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108369  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 		 100 aa  83.6  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0760  50S ribosomal protein L23  52.38 
 
 		 117 aa  83.6  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000631754  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  48.91 
 
 		 98 aa  83.6  9e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  46.39 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>