More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0710 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  100 
 
 
95 aa  191  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  56.99 
 
 
94 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  54.84 
 
 
94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  56.38 
 
 
98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  55.43 
 
 
97 aa  107  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
94 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
94 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  57.3 
 
 
95 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000032639  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  51.06 
 
 
94 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947106  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1348  50S ribosomal protein L23  51.61 
 
 
94 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
97 aa  100  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
97 aa  100  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  52.69 
 
 
95 aa  99  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2255  50S ribosomal protein L23  52.08 
 
 
96 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000014312  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 
94 aa  98.2  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  51.61 
 
 
94 aa  98.2  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  52.69 
 
 
95 aa  97.8  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 
97 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  51.06 
 
 
94 aa  94.7  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  53.68 
 
 
95 aa  95.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 
97 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  50.55 
 
 
96 aa  94  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 
97 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 
97 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0849  50S ribosomal protein L23P  47.78 
 
 
99 aa  93.6  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000828313  decreased coverage  0.0000112275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4003  Ribosomal protein L25/L23  46.6 
 
 
109 aa  92  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.68966 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  53.61 
 
 
98 aa  91.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1763  50S ribosomal protein L23  51.04 
 
 
96 aa  92  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00961532  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  51.09 
 
 
95 aa  90.9  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0081  50S ribosomal protein L23  51.04 
 
 
96 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2772  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 
96 aa  90.5  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0118683  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0061  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 
101 aa  89  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000105028  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2322  ribosomal L23 protein  52.33 
 
 
98 aa  88.6  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  48.42 
 
 
94 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 
94 aa  88.2  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  50.55 
 
 
99 aa  88.2  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  49.48 
 
 
94 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  48.91 
 
 
96 aa  85.5  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0662  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 
96 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  48 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  51.61 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  45.05 
 
 
98 aa  84.7  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0856  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 
98 aa  84.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483725  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 
97 aa  84.3  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 
97 aa  84.3  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 
94 aa  83.6  8e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0456  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
99 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0420406  unclonable  0.000000164588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4747  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
99 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000334762  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0486  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
99 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00438289  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0489  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
99 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000019112  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  51.61 
 
 
97 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  51.61 
 
 
97 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0471  50S ribosomal protein L23  51.16 
 
 
100 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000395002  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
97 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0499  50S ribosomal protein L23  46.34 
 
 
97 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.173851  hitchhiker  0.00000000336824 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3907  50S ribosomal protein L23  48.78 
 
 
99 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.104737  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06270  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
99 aa  82  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 
97 aa  82  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 
96 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  49.46 
 
 
98 aa  82.4  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0329  50S ribosomal protein L23  46.34 
 
 
97 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 
95 aa  82  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  52.17 
 
 
100 aa  81.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0585  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.720688 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03169  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000759178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0395  Ribosomal protein L25/L23  44.94 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000225919  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0476  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 
94 aa  80.9  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00880639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3801  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000749996  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03120  hypothetical protein  44.94 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000565358  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  49.46 
 
 
96 aa  80.9  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0278  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 
98 aa  81.3  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0453  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 
94 aa  80.9  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00013155  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4641  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287124  normal  0.0460173 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3512  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000392959  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1351  50S ribosomal protein L23  51.61 
 
 
104 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 
95 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0395  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000080861  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3613  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000847098  hitchhiker  0.00309782 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3703  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225733  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0628  ribosomal protein L23  47.56 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000267442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4546  50S ribosomal protein L23  47.56 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215144  normal  0.061023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5077  50S ribosomal protein L23  47.56 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000053863  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 
97 aa  80.5  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  51.81 
 
 
95 aa  80.5  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  47.83 
 
 
96 aa  80.5  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3749  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 
100 aa  80.1  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000048697  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 
97 aa  80.1  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3634  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 
100 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00980054  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3805  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 
100 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000686351  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  43.82 
 
 
100 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 
97 aa  80.1  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3993  Ribosomal protein L25/L23  47.31 
 
 
94 aa  79.7  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  43.82 
 
 
100 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000248684  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3634  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 
100 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000793915  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3707  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 
100 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000802937  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  43.82 
 
 
100 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108369  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3742  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 
100 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.344368  normal  0.0150111 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 
101 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3167  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>