More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4917 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  100 
 
 		 98 aa  201  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  64.21 
 
 		 94 aa  122  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  61.62 
 
 		 99 aa  121  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  61.46 
 
 		 94 aa  119  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  61.46 
 
 		 94 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  63.83 
 
 		 98 aa  114  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  56.7 
 
 		 95 aa  101  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  57.29 
 
 		 99 aa  100  8e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  55.56 
 
 		 94 aa  99.8  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  54.26 
 
 		 95 aa  97.4  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  55.67 
 
 		 95 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  54.64 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  54.55 
 
 		 98 aa  95.1  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 100 aa  94  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  53.61 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 95 aa  93.6  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  51.02 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  52.08 
 
 		 94 aa  92.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  47.96 
 
 		 98 aa  92  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  55.56 
 
 		 97 aa  92.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  53.61 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 		 98 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  54.26 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  53.19 
 
 		 95 aa  90.5  7e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 		 98 aa  90.5  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 96 aa  89.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  50 
 
 		 98 aa  89.4  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  52.13 
 
 		 99 aa  88.6  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  52.08 
 
 		 94 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  47.42 
 
 		 95 aa  87.8  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  48.98 
 
 		 98 aa  87.4  7e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  49.47 
 
 		 98 aa  87  7e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  49.46 
 
 		 98 aa  87  8e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  52.13 
 
 		 96 aa  87  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  51.04 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 98 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  50 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  51.04 
 
 		 95 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 93 aa  86.7  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 98 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  51.58 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  48.96 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  49.47 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  52.13 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0604  Ribosomal protein L25/L23  44.21 
 
 		 96 aa  85.5  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  51.58 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 		 100 aa  84.3  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 		 100 aa  84.3  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  52.13 
 
 		 100 aa  84  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  52.53 
 
 		 97 aa  84.3  6e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 		 101 aa  84  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  48.45 
 
 		 98 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 		 97 aa  83.6  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 100 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  48.48 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  48.42 
 
 		 99 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  50 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1681  50S ribosomal protein L23  49.47 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0570438  hitchhiker  0.0000115816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  49.48 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  49.47 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1125  Ribosomal protein L25/L23  48.45 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0844  Ribosomal protein L25/L23  45 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  49.47 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  45.74 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1356  ribosomal protein L25/L23  48.42 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.385939  normal  0.0499735 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2561  Ribosomal protein L25/L23  45.74 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0761  50S ribosomal protein L23  47.37 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679128  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05725  50S ribosomal protein L23  43.62 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  47.37 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  46.94 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  48.45 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  47.96 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1136  ribosomal protein L25/L23  54.02 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000719358  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  51.06 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5785  Ribosomal protein L25/L23  45.74 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0742289 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  47.96 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  47.96 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0453  50S ribosomal protein L23  44.79 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00013155  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0476  50S ribosomal protein L23  44.79 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00880639  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_419  ribosomal protein L23  44.79 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0245207  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  47.37 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0291  50S ribosomal protein L23  42.39 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>