More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0693 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  100 
 
 		 104 aa  205  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2561  Ribosomal protein L25/L23  78.85 
 
 		 104 aa  175  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  60.78 
 
 		 105 aa  129  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  63 
 
 		 100 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  63 
 
 		 100 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  55.88 
 
 		 101 aa  119  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  54.81 
 
 		 100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  56.31 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  59 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  55.34 
 
 		 100 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  58 
 
 		 100 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  56.31 
 
 		 100 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  52.48 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  48.54 
 
 		 103 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  48.54 
 
 		 103 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  52.08 
 
 		 97 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  50.5 
 
 		 100 aa  98.6  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  51.58 
 
 		 100 aa  97.8  5e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  53.41 
 
 		 95 aa  91.7  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 94 aa  87.8  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  49.38 
 
 		 95 aa  87.4  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  51.22 
 
 		 96 aa  84  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  48.24 
 
 		 94 aa  83.6  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  44.94 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  52.56 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  46.84 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  51.72 
 
 		 98 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  45.88 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  40.48 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  51.14 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  45.88 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  44.19 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  48.15 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  51.14 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  51.14 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  40.48 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  45.12 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  45.88 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  45.88 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  49.38 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  48.15 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  45.88 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  46.91 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  46.91 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  45.78 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  46.34 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  40.48 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  48.19 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  43.37 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  43.37 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  45.12 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4003  Ribosomal protein L25/L23  44.21 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.68966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  45.68 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  45.35 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  45.45 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  43.53 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  45.68 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  48.19 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  40.48 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  41.67 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  40.23 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  44.19 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  40.86 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  45.12 
 
 		 94 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 		 98 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 		 99 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  42.05 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0700  50S ribosomal protein L23  45.78 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000143862  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0668  50S ribosomal protein L23  45.78 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142276  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  45.68 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  43.9 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  48.15 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  40.48 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  45.68 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1356  ribosomal protein L25/L23  45.98 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.385939  normal  0.0499735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  38.64 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  42.05 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  44.19 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  47.5 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  45.68 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  46.67 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  40.45 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  41.11 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  41.11 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  41.11 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  41.11 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  39.42 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>