More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2230 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  100 
 
 		 100 aa  199  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  71.28 
 
 		 105 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  75.82 
 
 		 100 aa  142  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  75.82 
 
 		 100 aa  142  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  72.53 
 
 		 97 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  70.33 
 
 		 103 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  70.33 
 
 		 103 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  71.43 
 
 		 100 aa  138  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  69.23 
 
 		 100 aa  137  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  69.23 
 
 		 100 aa  137  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  69.23 
 
 		 100 aa  137  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  68.13 
 
 		 100 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  63 
 
 		 100 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  63 
 
 		 100 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2561  Ribosomal protein L25/L23  59.62 
 
 		 104 aa  124  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  60.82 
 
 		 110 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  54.81 
 
 		 104 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  56.25 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  55.29 
 
 		 95 aa  100  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 96 aa  89.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  51.16 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  47.13 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  47.13 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  46.74 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  51.19 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  51.19 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  47.78 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  52.38 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  44.21 
 
 		 99 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 97 aa  81.3  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  47.62 
 
 		 97 aa  80.1  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  47.62 
 
 		 97 aa  80.1  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  51.19 
 
 		 102 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  47.62 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  47.62 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1351  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  48.84 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  51.19 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  45.98 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  42.7 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  49.43 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  45.56 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  45.24 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  48.89 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  43.68 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  39.08 
 
 		 91 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  46.59 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  39.08 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  39.08 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  46.81 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0849  50S ribosomal protein L23P  42.39 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000828313  decreased coverage  0.0000112275 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  46.59 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  45.45 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000031737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  43.96 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  45.45 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  43.18 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  45.45 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  42.55 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  47.62 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  44.83 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  45.24 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  47.62 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  44.83 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1251  50S ribosomal protein L23  51.19 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.781143  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3993  Ribosomal protein L25/L23  45.05 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  46.43 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  43.18 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0278  50S ribosomal protein L23  46.43 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  42.53 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0761  50S ribosomal protein L23  47.62 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679128  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2838  50S ribosomal protein L23  42.71 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000238806  normal  0.241874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  45.24 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>