More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0849 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0849  50S ribosomal protein L23P  100 
 
 		 99 aa  202  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000828313  decreased coverage  0.0000112275 
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  54.26 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  54.26 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  54.26 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  54.26 
 
 		 97 aa  98.6  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  54.26 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  54.26 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 		 97 aa  96.7  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0856  50S ribosomal protein L23  49.47 
 
 		 98 aa  96.7  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483725  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3336  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000112822  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0962  50S ribosomal protein L23  51.04 
 
 		 98 aa  94  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000402083  hitchhiker  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0340  50S ribosomal protein L23  48.42 
 
 		 104 aa  93.6  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00586276  hitchhiker  0.000885961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0275  50S ribosomal protein L23  48.42 
 
 		 104 aa  94  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000521502  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 		 97 aa  94  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0280  50S ribosomal protein L23  48.42 
 
 		 104 aa  94  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00123621  hitchhiker  0.00000000748159 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 		 95 aa  93.6  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  48.35 
 
 		 99 aa  92.8  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 		 94 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0321  50S ribosomal protein L23  46.94 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.11411e-18  hitchhiker  0.000000647477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4911  50S ribosomal protein L23  48.42 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000771327  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0721  50S ribosomal protein L23  51.04 
 
 		 97 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000131875  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0456  50S ribosomal protein L23  51.06 
 
 		 99 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0420406  unclonable  0.000000164588 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2370  ribosomal protein L23  46.81 
 
 		 97 aa  91.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0489  50S ribosomal protein L23  51.06 
 
 		 99 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000019112  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 		 94 aa  92  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947106  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  48.94 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4747  50S ribosomal protein L23  51.06 
 
 		 99 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000334762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0486  50S ribosomal protein L23  51.06 
 
 		 99 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00438289  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0628  ribosomal protein L23  50 
 
 		 99 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000267442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4546  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 99 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215144  normal  0.061023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5077  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 99 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000053863  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2948  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 		 104 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000296107  hitchhiker  0.000000753496 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3295  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 		 104 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000040814  hitchhiker  0.0000223362 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0585  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 98 aa  90.5  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.720688 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0278  50S ribosomal protein L23  51.14 
 
 		 98 aa  90.5  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3907  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 		 99 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.104737  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3017  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000878321  decreased coverage  0.0020306 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 		 94 aa  89.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0055  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233404  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  52.27 
 
 		 98 aa  89.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0668  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142276  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0471  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 		 100 aa  89.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000395002  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0700  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000143862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1348  50S ribosomal protein L23  41.94 
 
 		 94 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3177  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000279852  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4274  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000576147  unclonable  0.00000000000382148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3315  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  51.11 
 
 		 97 aa  89.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0052  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000136053  hitchhiker  3.59649e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2322  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 		 98 aa  88.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000334931  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  53.93 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  46.74 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0205  50S ribosomal protein L23  48.42 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0499  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 		 97 aa  88.2  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.173851  hitchhiker  0.00000000336824 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0839  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 		 99 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0329  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 		 97 aa  88.2  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08870  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 		 99 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.679116  hitchhiker  0.00894178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0393  50S ribosomal protein L23  46.32 
 
 		 104 aa  87.8  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000842978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  46.88 
 
 		 96 aa  87.4  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  48.91 
 
 		 98 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0061  50S ribosomal protein L23  51.58 
 
 		 101 aa  87.4  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000105028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 		 94 aa  87.4  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 		 94 aa  87.4  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  48.91 
 
 		 98 aa  87  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0316  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000511744  decreased coverage  0.00276856 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3642  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101067  hitchhiker  0.0000000000169859 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2838  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000238806  normal  0.241874 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2322  ribosomal L23 protein  43.62 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 		 99 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0769  ribosomal L23 protein  44.33 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.187715  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0871  50S ribosomal protein L23  45.74 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06270  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 		 99 aa  84.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219554  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  48.91 
 
 		 99 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0281  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 		 102 aa  84.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000926616  hitchhiker  0.00000149946 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  48.91 
 
 		 99 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1266  50S ribosomal protein L23  42.42 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000310284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 100 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1351  50S ribosomal protein L23  48.91 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3441  50S ribosomal protein L23  45.26 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.0000520161  normal  0.334367 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3793  50S ribosomal protein L23  45.26 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0844484  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  45.83 
 
 		 100 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 		 100 aa  84.3  6e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 		 100 aa  84  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  48.91 
 
 		 99 aa  84.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0278  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000301066  normal  0.113282 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1926  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000597608  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3774  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000518594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3802  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00374922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3744  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000010751  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3066  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181446  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0329  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000104942  normal  0.0187974 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0269  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000217193  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0350  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>