More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0060 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  100 
 
 
98 aa  194  5.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  96.94 
 
 
98 aa  189  7e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  71.43 
 
 
97 aa  142  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  58.24 
 
 
96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  58.24 
 
 
96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000031737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  58.24 
 
 
96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  58.24 
 
 
96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  58.24 
 
 
96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  58.24 
 
 
96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  58.24 
 
 
96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  58.24 
 
 
96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  58.24 
 
 
96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  58.24 
 
 
96 aa  107  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  57.14 
 
 
96 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  58.43 
 
 
95 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  57.3 
 
 
95 aa  100  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  51.02 
 
 
98 aa  98.6  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  55.91 
 
 
91 aa  98.2  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  57.14 
 
 
96 aa  98.6  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  55.91 
 
 
91 aa  98.2  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  52.69 
 
 
95 aa  98.6  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  56.99 
 
 
91 aa  97.4  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  54.35 
 
 
99 aa  97.1  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
98 aa  94  7e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
97 aa  91.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  48.94 
 
 
95 aa  91.3  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  56.99 
 
 
93 aa  90.1  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  54.44 
 
 
97 aa  88.2  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  50.55 
 
 
100 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 
100 aa  84.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  53.85 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  54.17 
 
 
95 aa  84.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0597  50S ribosomal protein L23P  47.96 
 
 
99 aa  84.3  5e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000650952  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  48.96 
 
 
103 aa  84.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 
100 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  48.96 
 
 
103 aa  84.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  48.78 
 
 
101 aa  84  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 
100 aa  83.6  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1125  Ribosomal protein L25/L23  49.45 
 
 
98 aa  83.6  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 
95 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  51.58 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 
100 aa  82  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 
100 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  48.45 
 
 
98 aa  80.9  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 
94 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 
97 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  53.85 
 
 
95 aa  80.1  0.000000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 
94 aa  79.7  0.00000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 
100 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  52.22 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  52.22 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  50.53 
 
 
94 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  51.06 
 
 
94 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  53.76 
 
 
94 aa  78.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  48.42 
 
 
98 aa  78.2  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  46.74 
 
 
94 aa  78.2  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3993  Ribosomal protein L25/L23  54.12 
 
 
94 aa  77.4  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  48.19 
 
 
100 aa  77.4  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  48.19 
 
 
100 aa  77.4  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 
94 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf441  50S ribosomal protein L23  46.94 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  51.11 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  42.27 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  51.19 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  49.46 
 
 
99 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  48.91 
 
 
95 aa  75.5  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 
99 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
117 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  51.06 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  51.11 
 
 
93 aa  75.1  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  45.12 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  48.91 
 
 
95 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0760  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000631754  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 
103 aa  72  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  49.46 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  46.15 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  47.5 
 
 
98 aa  71.2  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0194  Ribosomal protein L25/L23  48.42 
 
 
94 aa  71.2  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0476  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00880639  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0491  50S ribosomal protein L23  45.24 
 
 
116 aa  70.9  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310283  hitchhiker  0.00323784 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1136  ribosomal protein L25/L23  48.96 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000719358  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0486  50S ribosomal protein L23  45.24 
 
 
116 aa  70.9  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000945976  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_419  ribosomal protein L23  45.16 
 
 
94 aa  71.2  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0245207  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0453  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00013155  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0428  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291057  decreased coverage  0.00000564548 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  48.35 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  46.59 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  48.35 
 
 
100 aa  70.5  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2561  Ribosomal protein L25/L23  41.46 
 
 
104 aa  70.1  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  47.25 
 
 
101 aa  70.1  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  48.35 
 
 
100 aa  70.1  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000032639  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3756  Ribosomal protein L25/L23  46.15 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>