More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1865 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  100 
 
 		 95 aa  192  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  57.61 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2905  Ribosomal protein L25/L23  57.78 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  58.33 
 
 		 100 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  58.33 
 
 		 97 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  51.14 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  55.95 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  55.95 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  55.29 
 
 		 100 aa  100  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  54.76 
 
 		 100 aa  99.4  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  54.76 
 
 		 100 aa  97.8  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  55.95 
 
 		 100 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  54.76 
 
 		 100 aa  97.1  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  54.76 
 
 		 100 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  53.57 
 
 		 100 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  55.06 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  52.38 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  52.69 
 
 		 94 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  48.98 
 
 		 99 aa  90.5  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  51.14 
 
 		 94 aa  89.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  49.41 
 
 		 100 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 		 97 aa  89.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 		 97 aa  89.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  49.41 
 
 		 100 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 		 95 aa  87.8  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  49.38 
 
 		 104 aa  87.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2561  Ribosomal protein L25/L23  50.62 
 
 		 104 aa  87  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  49.41 
 
 		 98 aa  86.7  9e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  43.96 
 
 		 94 aa  86.7  1e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  47.37 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  51.19 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  49.41 
 
 		 98 aa  84.7  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  47.31 
 
 		 94 aa  84.3  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  49.46 
 
 		 94 aa  84  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 		 94 aa  83.6  8e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  48.19 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  47.19 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  47.78 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  45.16 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  49.43 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  47.19 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 		 101 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  50.62 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  48.15 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0597  50S ribosomal protein L23P  44.21 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000650952  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  50.62 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  45.05 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  46.74 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 		 98 aa  80.1  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  48.86 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  47.62 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0721  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000131875  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  44.71 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  47.56 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  48.78 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  48.28 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  46.67 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  42.35 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  47.56 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  47.73 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  48.81 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  42.35 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  50.63 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  41.18 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  47.56 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  42.27 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  46.43 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947106  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  48.28 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  42.27 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  46.91 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  46.91 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  43.33 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5047  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185864  normal  0.262037 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  41.11 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  48.24 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>