More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl125 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  100 
 
 
94 aa  190  6e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  78.72 
 
 
94 aa  157  5e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf441  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 
181 aa  94.7  4e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 
95 aa  94  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  53.33 
 
 
95 aa  93.6  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  52.17 
 
 
91 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  56.1 
 
 
97 aa  92.8  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  52.17 
 
 
91 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 
97 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 
97 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  52.17 
 
 
94 aa  92.8  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  52.17 
 
 
91 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1348  50S ribosomal protein L23  52.17 
 
 
94 aa  90.9  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  49.47 
 
 
96 aa  90.1  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 
105 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  52.22 
 
 
95 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  43.96 
 
 
95 aa  86.7  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  51.76 
 
 
98 aa  86.7  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 
94 aa  84.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  47.78 
 
 
96 aa  84.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  49.44 
 
 
98 aa  85.1  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  45.45 
 
 
98 aa  84.3  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 
95 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 
98 aa  84.3  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  46.74 
 
 
94 aa  84  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 
95 aa  83.6  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  43.62 
 
 
98 aa  82.8  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
98 aa  82.4  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  46.74 
 
 
95 aa  82  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 
94 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3160  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 
95 aa  80.5  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  45.74 
 
 
95 aa  80.5  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  42.86 
 
 
94 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  48.86 
 
 
100 aa  80.1  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 
98 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2905  Ribosomal protein L25/L23  44.44 
 
 
96 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 
95 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000032639  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  46.51 
 
 
101 aa  79.7  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 
97 aa  79.3  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  43.18 
 
 
95 aa  79.7  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  40.22 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  40.22 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  42.39 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  45.56 
 
 
96 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 
94 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  50 
 
 
93 aa  78.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  51.28 
 
 
95 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  40.22 
 
 
100 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  47.13 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  49.43 
 
 
96 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  47.73 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 
94 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947106  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4345  Ribosomal protein L25/L23  48.91 
 
 
95 aa  77  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000178584  normal  0.183841 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  50.57 
 
 
101 aa  77  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  50.57 
 
 
101 aa  77  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 
98 aa  77  0.00000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  42.39 
 
 
103 aa  77  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  42.39 
 
 
103 aa  77  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 
100 aa  76.6  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0194  Ribosomal protein L25/L23  50.56 
 
 
94 aa  77  0.00000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  41.3 
 
 
94 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0428  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291057  decreased coverage  0.00000564548 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 
100 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  41.3 
 
 
94 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 
100 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  49.43 
 
 
101 aa  75.9  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  45.45 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  46.07 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  42.39 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  45.74 
 
 
98 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0302  Ribosomal protein L25/L23  50.56 
 
 
94 aa  75.9  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.055916  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  47.13 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  44.68 
 
 
94 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  43.18 
 
 
93 aa  74.7  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  42.39 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  47.44 
 
 
117 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  47.56 
 
 
101 aa  74.3  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  46.59 
 
 
103 aa  74.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 
96 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0491  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 
116 aa  73.9  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310283  hitchhiker  0.00323784 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0486  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 
116 aa  73.9  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000945976  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  42.53 
 
 
95 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0195  50S ribosomal protein L23  43.62 
 
 
95 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0329  50S ribosomal protein L23  45.35 
 
 
97 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 
96 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 
96 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 
96 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3177  50S ribosomal protein L23  40.22 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000279852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 
96 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  41.76 
 
 
96 aa  72.8  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 
96 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 
96 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 
96 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3315  50S ribosomal protein L23  40.22 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957307  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  48.72 
 
 
95 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  43.18 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>