More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3993 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3993  Ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 94 aa  185  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0194  Ribosomal protein L25/L23  55.91 
 
 		 94 aa  103  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  49.46 
 
 		 97 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  53.26 
 
 		 95 aa  88.2  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  49.46 
 
 		 97 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  52.69 
 
 		 95 aa  84.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  54.55 
 
 		 93 aa  84.3  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 		 97 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  56.82 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  51.61 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  51.58 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 		 94 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  46.07 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  51.16 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  51.14 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  54.12 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf441  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 		 181 aa  77  0.00000000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  54.55 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  54.12 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  48.89 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  51.16 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  45.16 
 
 		 94 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  47.31 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 		 100 aa  73.6  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0758  50S ribosomal protein L23  45.98 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156644  normal  0.0173378 
 
 
-
 
NC_002936  DET0476  50S ribosomal protein L23  40.86 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00880639  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 97 aa  73.6  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 97 aa  73.6  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 97 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 97 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1251  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.781143  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0453  50S ribosomal protein L23  39.78 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00013155  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  51.16 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1136  ribosomal protein L25/L23  55.56 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000719358  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  50.56 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  46.43 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  45.56 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_419  ribosomal protein L23  39.78 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0245207  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1351  50S ribosomal protein L23  46.51 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  49.43 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  48.84 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  48.84 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  48.84 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4003  Ribosomal protein L25/L23  44.55 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.68966 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  51.16 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  43.53 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0278  50S ribosomal protein L23  47.67 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  50.59 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  42.39 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  48.78 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  43.82 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3177  50S ribosomal protein L23  48.28 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000279852  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1348  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3315  50S ribosomal protein L23  48.28 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  47.67 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2948  50S ribosomal protein L23  48.28 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000296107  hitchhiker  0.000000753496 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  48.84 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0761  50S ribosomal protein L23  46.51 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679128  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3295  50S ribosomal protein L23  48.28 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000040814  hitchhiker  0.0000223362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  47.67 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3017  50S ribosomal protein L23  48.28 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000878321  decreased coverage  0.0020306 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  47.73 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0499  50S ribosomal protein L23  44.19 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.173851  hitchhiker  0.00000000336824 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0329  50S ribosomal protein L23  44.19 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  42.22 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0435  50S ribosomal protein L23  45.98 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00486251  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  48.78 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  42.22 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  48.86 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4274  50S ribosomal protein L23  45.98 
 
 		 98 aa  67  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000576147  unclonable  0.00000000000382148 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0496  50S ribosomal protein L23  44.83 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000003402  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>