More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1125 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1125  Ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 98 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  76.04 
 
 		 103 aa  153  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3756  Ribosomal protein L25/L23  72.92 
 
 		 101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  73.96 
 
 		 103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  73.2 
 
 		 99 aa  144  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  74.47 
 
 		 100 aa  142  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5047  50S ribosomal protein L23  76.6 
 
 		 100 aa  140  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185864  normal  0.262037 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1042  50S ribosomal protein L23  74.47 
 
 		 100 aa  139  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1015  50S ribosomal protein L23  74.47 
 
 		 100 aa  139  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1032  50S ribosomal protein L23  74.47 
 
 		 100 aa  139  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  75.53 
 
 		 100 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  64.95 
 
 		 98 aa  127  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  72.63 
 
 		 100 aa  127  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  70.21 
 
 		 99 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  65.98 
 
 		 98 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1187  Ribosomal protein L25/L23  62.24 
 
 		 104 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.102596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  68.09 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  69.15 
 
 		 96 aa  124  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  63.16 
 
 		 98 aa  122  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  68.75 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  64.21 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  68.75 
 
 		 100 aa  120  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  64.89 
 
 		 101 aa  118  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  68.09 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  68.09 
 
 		 100 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  67.02 
 
 		 100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  61.46 
 
 		 101 aa  116  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  61.46 
 
 		 101 aa  116  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  63.83 
 
 		 101 aa  117  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  65.26 
 
 		 100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  64.29 
 
 		 100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  63.16 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  63.83 
 
 		 103 aa  114  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  65.22 
 
 		 107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  67.05 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  56.7 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  62.22 
 
 		 98 aa  108  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  54.84 
 
 		 97 aa  103  8e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  61.11 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  51.61 
 
 		 93 aa  94  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  46.15 
 
 		 99 aa  92.8  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  50.53 
 
 		 93 aa  90.9  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  47.37 
 
 		 95 aa  87  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  49.48 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  47.92 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  49.48 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  47.42 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 95 aa  83.6  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 		 98 aa  83.6  9e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 		 97 aa  83.6  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  50.51 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  48.94 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  50.51 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  49.46 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  50.51 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  50.51 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  48.45 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000031737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  51.61 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  51.58 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  49.49 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  51.06 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  48.48 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0760  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000631754  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0400  Ribosomal protein L25/L23  54.55 
 
 		 98 aa  76.6  0.00000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2227  50S ribosomal protein L23  50.53 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000627291  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  48.39 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  46.24 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  46.32 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  47.87 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  46.74 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2905  Ribosomal protein L25/L23  47.31 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  46.32 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  48.45 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  48.96 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  49.4 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  45.74 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 		 97 aa  72  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>