More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0267 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  100 
 
 
99 aa  200  5e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  55.32 
 
 
96 aa  90.5  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  47.96 
 
 
94 aa  89  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 
98 aa  87.8  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  54.44 
 
 
93 aa  85.5  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0291  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 
94 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 
98 aa  84.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 
94 aa  83.6  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  48.98 
 
 
99 aa  83.2  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  46.32 
 
 
100 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  49.47 
 
 
96 aa  82  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2421  50S ribosomal protein L23  43.88 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00215934  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  46.46 
 
 
95 aa  81.3  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 
95 aa  81.3  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  46.94 
 
 
95 aa  80.9  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  53.33 
 
 
101 aa  80.9  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2227  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000627291  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  45.92 
 
 
93 aa  79.3  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  55.32 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1187  Ribosomal protein L25/L23  50.56 
 
 
104 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.102596 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2772  50S ribosomal protein L23  45.65 
 
 
96 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0118683  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0604  Ribosomal protein L25/L23  43.01 
 
 
96 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0182  50S ribosomal protein L23  41.84 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000184382  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2062  50S ribosomal protein L23  43.88 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000372125  normal  0.225776 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05725  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 
96 aa  78.2  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0662  50S ribosomal protein L23  45.65 
 
 
96 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2255  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 
96 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000014312  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  43.62 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0761  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 
98 aa  77  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679128  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1617  Ribosomal protein L25/L23  39.36 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  55.42 
 
 
100 aa  76.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 
103 aa  76.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  55.42 
 
 
100 aa  76.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2294  50S ribosomal protein L23  39.8 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0336822  normal  0.0105282 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0395  50S ribosomal protein L23  43.96 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  45.92 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1136  ribosomal protein L25/L23  51.76 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000719358  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  43.43 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000032639  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  48.84 
 
 
98 aa  75.1  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3756  Ribosomal protein L25/L23  46.67 
 
 
101 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0407  50S ribosomal protein L23P  44.09 
 
 
101 aa  74.7  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000028308  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  53.33 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1125  Ribosomal protein L25/L23  48.45 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0844  Ribosomal protein L25/L23  46.24 
 
 
100 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4003  Ribosomal protein L25/L23  43.64 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.68966 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0871  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 
100 aa  73.6  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  44.79 
 
 
96 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 
110 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1849  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.310449  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  44.21 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
97 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5047  50S ribosomal protein L23  48.96 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185864  normal  0.262037 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  47.73 
 
 
97 aa  72.4  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1936  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 
95 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1042  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1015  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
95 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1032  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  45.26 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  40.82 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000031737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
98 aa  70.5  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  43.82 
 
 
98 aa  70.5  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 
98 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 
100 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  45.65 
 
 
97 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 
100 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0585  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 
98 aa  70.1  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.720688 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  45.83 
 
 
100 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  41.41 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  41.49 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00732  50S ribosomal protein L23  45.65 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0491  50S ribosomal protein L23  39.36 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.98557  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  45.65 
 
 
97 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 
95 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  45.65 
 
 
97 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001740  LSU ribosomal protein L23p (L23Ae)  45.65 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000423409  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  41.94 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
101 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>