More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0195 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0195  50S ribosomal protein L23  100 
 
 		 95 aa  186  7e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3160  50S ribosomal protein L23  58.95 
 
 		 95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_002950  PG1936  50S ribosomal protein L23  56.7 
 
 		 97 aa  105  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0395  50S ribosomal protein L23  52.08 
 
 		 96 aa  94.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1617  Ribosomal protein L25/L23  54.26 
 
 		 99 aa  93.6  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0844  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 100 aa  91.3  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5785  Ribosomal protein L25/L23  48.42 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0742289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0604  Ribosomal protein L25/L23  45.83 
 
 		 96 aa  89.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4345  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 95 aa  87.8  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000178584  normal  0.183841 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  51.61 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  53.76 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05725  50S ribosomal protein L23  42.71 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947106  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1149  Ribosomal protein L25/L23  43.75 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000523481  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  44.68 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0291  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2062  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000372125  normal  0.225776 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  47.87 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  41.49 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  43.62 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  44.57 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2227  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000627291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  43.16 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2294  50S ribosomal protein L23  41.11 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0336822  normal  0.0105282 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1348  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  43.01 
 
 		 93 aa  70.5  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  40.22 
 
 		 98 aa  70.1  0.000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  48.28 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  42.55 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1849  50S ribosomal protein L23  43.68 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.310449  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  48.28 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  44.94 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0182  50S ribosomal protein L23  42.22 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000184382  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  41.49 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  47.13 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  41.86 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  43.16 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0760  50S ribosomal protein L23  46.43 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000631754  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  45.56 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  45.35 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0662  50S ribosomal protein L23  41.05 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  44.05 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  48.91 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000032639  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2421  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00215934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  42.55 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  41.05 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  44.83 
 
 		 101 aa  67  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  39.78 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  37.63 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  38.46 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  39.36 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  36.84 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2255  50S ribosomal protein L23  45.74 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000014312  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  40.66 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  38.89 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  39.36 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  39.36 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  39.36 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  40.62 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  38.46 
 
 		 96 aa  62  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  44.09 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  38.3 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  43.02 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4003  Ribosomal protein L25/L23  37.04 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.68966 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  38.89 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  38.14 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  38.89 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  37.78 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1763  50S ribosomal protein L23  41.49 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00961532  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  41.38 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  41.38 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  43.53 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  38.46 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  38.46 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  40.66 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  36.26 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0486  50S ribosomal protein L23  41.94 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000945976  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  43.68 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>